结论：只有拆迁协议的房子，法院在特定条件下是有权查封的。

分析说明：

1. 拆迁协议的法律性质：

   • 拆迁协议是拆迁人与被拆迁人之间就房屋拆迁、补偿等事项达成的协议。它本身并不直接等同于房屋的所有权证明，但在协议有效且双方均未违约的情况下，拆迁协议可以视为被拆迁人对房屋享有某种权益（如补偿权）的依据。

2. 法院查封的法律依据：

   • 法院查封财产通常基于法律文书（如判决书、裁定书）或执行申请，且该财产需属于被执行人所有或有权处分的范围。在拆迁情境中，如果房屋已被纳入拆迁范围，且拆迁协议已签订，但房屋尚未实际拆除或补偿款未支付完毕，此时房屋或相关权益可能仍属于被拆迁人。
   • 若被拆迁人因其他债务纠纷被法院执行，且其名下无其他可供执行的财产，而拆迁协议中的补偿款或房屋置换权益被视为其可执行的财产时，法院有权根据相关法律程序对这部分权益进行查封。

3. 查封的具体条件：

   • 存在有效法律文书：如判决书、裁定书等，确认被拆迁人需承担某种法律责任或义务。
   • 拆迁协议与被执行财产的关联性：拆迁协议中的补偿款或房屋置换权益需明确属于被拆迁人，且未被其他法律文书或协议排除在执行范围之外。
   • 执行程序的合法性：法院需遵循法定程序进行查封，包括但不限于送达查封裁定书、通知相关利害关系人等。

4. 特殊情况考虑：

   • 如果拆迁协议已经明确约定了补偿款的支付方式和时间，且被拆迁人已经按照协议履行了相关义务（如腾空房屋等），此时补偿款可能已转化为被拆迁人的个人财产，法院在查封时需考虑这一因素。
   • 如果拆迁协议涉及多方利益（如共有产权人、抵押权人等），法院在查封时需平衡各方利益，确保查封行为不损害其他合法权利人的权益。

法律建议：

• 对于被拆迁人而言，如果面临法院查封的风险，应及时咨询专业律师，了解自身权益和可能的法律救济途径。
• 在签订拆迁协议时，应明确约定补偿款的支付方式、时间以及房屋置换的具体条款，以减少后续纠纷的可能性。
• 如果拆迁协议已经签订且房屋或相关权益被法院查封，被拆迁人应积极配合法院的执行工作，同时寻求法律途径维护自身合法权益。

可能后果：

• 如果法院查封行为合法且符合程序要求，被拆迁人需按照法院的要求履行相关义务，否则可能面临更严重的法律后果（如强制执行、罚款等）。
• 如果被拆迁人认为法院的查封行为存在错误或不当之处，可以通过法律途径提出异议或申请复议，以维护自身合法权益。