未保留工资条并不影响你起诉公司，但需要收集其他证据来证明公司存在未支付或克扣工资等违法行为，以下是具体分析和建议：

1. 法律基础与起诉条件
   根据《劳动争议调解仲裁法》及《工资支付暂行规定》，劳动者与用人单位发生工资争议时，举证责任原则上由用人单位承担（如工资支付记录、考勤记录等）。但若劳动者主张公司存在未足额支付工资、克扣工资等行为，仍需提供初步证据证明双方存在劳动关系及工资争议事实。工资条是直接证据之一，但并非唯一证据。

2. 未保留工资条时的替代证据收集方向

   • 银行流水：通过工资卡交易记录证明公司定期支付工资的金额、时间，与劳动合同约定的工资标准对比，发现差异时可主张公司违约。
     
   • 劳动合同：合同中约定的工资结构（如基本工资、绩效工资比例）、支付时间等条款，是证明工资标准的核心依据。
     
   • 同事证言：若多名同事能证明公司普遍存在克扣工资、未发放工资条等行为，可形成间接证据链（需注意证人出庭作证的可能性）。
     
   • 公司通知或制度：如公司内部邮件、公告中关于工资调整、扣款的规定，可能成为证明公司违法操作的证据。
     
   • 社保与个税记录：通过社保缴纳基数、个税申报金额，间接推断公司实际支付的工资是否低于应发标准。
     

3. 起诉前的关键步骤

   • 与公司协商：先通过书面形式（如邮件、短信）向公司人力资源部门或上级提出异议，要求提供工资条并补发差额。协商记录可作为后续诉讼中“公司拒不履行义务”的证据。
     
   • 申请劳动仲裁：根据《劳动争议调解仲裁法》，工资争议需先向劳动仲裁委员会申请仲裁，对结果不服方可起诉至法院。仲裁阶段需提交上述替代证据，并明确仲裁请求（如补发工资、支付经济补偿金等）。
     
   • 计算损失金额：根据劳动合同、银行流水等证据，精确计算公司未支付的工资差额、加班费、年终奖等，避免因金额争议影响仲裁/诉讼效率。
     

4. 诉讼中的注意事项

   • 证据形式要求：银行流水需加盖银行公章，劳动合同需提供原件，同事证言需证人出庭或提交书面证词并附身份证复印件。
     
   • 公司反证应对：若公司主张“已发放工资条但劳动者未领取”或“扣款系合法依据”（如迟到罚款、绩效不达标），需要求公司提供签字确认的工资条、考勤记录、绩效考核制度等证据。若公司无法提供，则其主张难以成立。
     
   • 时效问题：劳动争议申请仲裁的时效为1年，从劳动者知道或应当知道权利被侵害之日起计算（如每月工资发放日次日）。逾期可能丧失胜诉权。
     

行动建议：立即整理银行流水、劳动合同等现有证据，向公司发送书面异议函（保留寄送凭证），并尽快向当地劳动仲裁委员会申请仲裁。若对证据收集或程序有疑问，可直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供进一步指导。