针对您提出的“机关事业在编人员处理在编工作人员自动离职的程序”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，机关事业在编人员的自动离职处理，主要涉及到的是工龄计算、编制关系取消以及相关手续的办理。虽然直接针对“自动离职程序”的详细步骤可能因地区和单位的具体规定而有所不同，但我可以根据一般性的规定和流程，为您梳理出一个大致的处理框架。

一、工龄计算

根据人事部及相关文件的规定，机关、事业单位工作人员自动离职后，其工龄的计算方式有所特别。具体来说，自动离职人员的工龄是从其重新录用之日起开始计算的，这与辞职和辞退前的工龄计算方式有所不同（辞职和辞退前的工龄与重新就业后的工龄可合并计算为连续工龄）。这一点在处理自动离职人员时需要特别注意。

二、自动离职处理程序

虽然具体的自动离职处理程序可能因单位而异，但通常可以包括以下几个步骤：

1. 提交离职申请：

   • 在编工作人员如有自动离职意愿，应首先向所在单位提交书面离职申请，明确表达离职意愿及离职时间。

2. 单位审批：

   • 离职申请需经所在单位及主管部门审批。审批过程中，单位可能会与离职人员进行面谈，了解离职原因，并尝试进行挽留或协商解决相关问题。

3. 办理离职手续：

   • 一旦离职申请获得批准，离职人员需按照单位要求办理一系列离职手续，包括但不限于填写离职表格、交接工作、归还单位财产等。
   • 在此过程中，单位人事管理部门会填写相关解除聘用合同的证明书及备案表，并到人力资源和社会保障局进行鉴证备案。

4. 取消编制及财政供给关系：

   • 离职手续办理完毕后，单位需到编制部门取消离职人员的编制关系。
   • 如离职人员由财政开资，还需到财政部门取消财政供给关系。

5. 办理医保、社保转移：

   • 离职人员需到医保局和社保局办理医保、社保的转移或续接手续，确保个人权益不受影响。

6. 档案转移：

   • 如离职人员有新单位接收，新单位需向原单位档案管理部门发商调档案函，以调动个人档案。

三、注意事项

• 在处理自动离职时，单位应确保所有手续合法合规，避免产生不必要的法律纠纷。
• 离职人员应积极配合单位办理离职手续，确保个人权益得到妥善保障。
• 如对离职处理程序有疑问或不满，离职人员可向单位人事管理部门或上级主管部门咨询或申诉。

综上所述，机关事业在编人员处理在编工作人员自动离职的程序涉及多个环节和部门，需要离职人员和单位共同配合完成。希望以上解答能对您有所帮助。如有任何进一步的问题或疑虑，请随时咨询。