结论：在农村购买房子，仅签订双方协议而未进行公证，该协议在法律上仍具有一定的效力，但可能面临一些法律风险和不确定性。以下是对此问题的详细分析：

一、双方协议的法律效力

1. 合同成立与生效：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同是双方意思表示一致的协议，只要双方具备相应的民事行为能力，意思表示真实，且合同内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，合同即成立并生效。
   • 在农村购买房屋时，双方签订的协议，如果满足上述条件，即使未进行公证，也是具有法律效力的。

2. 公证的作用：

   • 公证是一种法律证明行为，它可以增强合同的证据效力，使合同在争议解决时更容易被法院或仲裁机构采纳。
   • 但公证并非合同生效的必要条件，未公证的合同，只要满足合同成立与生效的条件，同样具有法律效力。

二、未公证可能带来的法律风险

1. 证据效力问题：

   • 未公证的协议，在发生争议时，可能需要通过其他证据来证明其真实性和合法性，这可能会增加举证的难度和成本。
   • 如果协议内容存在模糊或歧义，未公证可能导致双方对协议解释产生争议，进而影响合同的履行和争议解决。

2. 房屋产权转移问题：

   • 在农村，房屋产权的转移可能涉及土地使用权的变更等问题，这些变更通常需要办理相关的登记手续。
   • 如果仅签订协议而未办理产权转移登记手续，即使协议有效，也可能面临房屋产权无法实际转移的风险。

3. 政策风险：

   • 农村房屋买卖可能受到当地政策、法规的限制和约束，如宅基地使用权的转让等。
   • 未公证的协议可能无法充分反映这些政策、法规的要求，从而增加交易的风险和不确定性。

三、建议与措施

1. 完善协议内容：

   • 在签订协议时，应确保协议内容明确、具体、无歧义，并涵盖房屋的基本情况、交易价格、付款方式、产权转移等关键条款。
   • 可以考虑在协议中约定违约责任和争议解决方式，以增强协议的约束力和可执行性。

2. 办理公证手续：

   • 虽然公证不是合同生效的必要条件，但办理公证可以增强合同的证据效力，降低争议解决的成本和风险。
   • 如果条件允许，建议对协议进行公证，以确保其真实性和合法性。

3. 办理产权转移登记手续：

   • 在农村购买房屋时，应按照当地政策、法规的要求办理产权转移登记手续，以确保房屋产权的实际转移。
   • 办理产权转移登记手续是保障交易安全、避免法律风险的重要措施。

4. 咨询专业律师：

   • 在进行农村房屋买卖时，建议咨询专业律师的意见和建议，以确保交易的合法性和安全性。
   • 如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供针对性的法律建议。

总结：在农村购买房子时，仅签订双方协议而未进行公证，该协议在法律上仍具有一定的效力，但可能面临一些法律风险和不确定性。为了降低这些风险和不确定性，建议完善协议内容、办理公证手续、办理产权转移登记手续，并咨询专业律师的意见和建议。