不可以直接铲除地上农作物，此行为可能引发法律风险。以下从不同角度进行分析：

1. 物权保护角度
   根据《民法典》第236条，物权受到侵害时，权利人可通过和解、调解、仲裁或诉讼等合法途径解决。直接铲除农作物属于私力救济行为，若未满足”情况紧迫且不能及时获得国家机关保护”的法定条件（如对方正在实施破坏行为且公权力介入滞后），则可能构成对他人财产权的侵害，需承担赔偿责任。

2. 土地管理法规角度
   若侵占行为涉及改变土地用途（如将耕地转为建设用地），根据《土地管理法》第77条，应由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还土地、限期拆除地上建筑物。权利人擅自处置可能干扰行政执法程序，甚至因破坏现场证据影响后续维权。

3. 侵权责任角度
   即使对方存在非法侵占行为，直接铲除农作物仍可能被认定为”以违法对抗违法”。根据《民法典》第1165条，需就农作物价值、生长周期等损失承担举证责任，若无法证明对方存在重大过错或故意，可能面临反诉风险。

建议处理流程：

1. 固定证据：通过拍照、录像、公证等方式记录土地现状及农作物价值
2. 行政投诉：向当地农业农村局或自然资源部门举报非法占地行为
3. 民事诉讼：提起返还原物请求权之诉，要求排除妨害并赔偿损失
4. 刑事报案：若涉及毁坏青苗价值达5000元以上，可向公安机关控告故意毁坏财物罪

特殊情形：
若遇紧急情况（如农作物即将成熟导致证据灭失），可依据《民法典》第1177条实施自助行为，但需立即联系执法部门到场见证，并在事后24小时内报案，否则仍需承担相应责任。

建议优先通过法律程序主张权利，如需进一步分析具体案情，可提供土地权属证明、侵占时间等细节继续咨询。