针对您提出的“物流车出车祸挂靠公司怎么赔偿”的问题，这确实是一个涉及多个法律层面和实际操作流程的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、责任主体与赔偿原则
挂靠人与被挂靠公司的连带责任：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，以挂靠形式从事道路运输经营活动的机动车，发生交通事故造成损害，且属于该机动车一方责任的，挂靠人和被挂靠公司需承担连带责任。这意味着，无论是挂靠的个人还是被挂靠的物流公司，都有可能成为赔偿的责任主体。
保险赔付：
- 物流车通常投保有交强险和商业第三者责任险。在事故发生后，首先由交强险在责任限额范围内进行赔偿，不区分事故责任比例。若损失超出交强险范围，且物流车还投保了商业险，则商业险部分将按照保险合同的约定进行赔付。
二、具体赔偿情况分析
物流车自身损失：
- 如果物流车在事故中受损，且该损失属于保险责任范围，那么应首先通过物流车的车损险进行赔付。若车损险不足以覆盖全部损失，或者物流车未投保车损险，则剩余损失可能需由挂靠人和被挂靠公司根据责任比例分担。
第三方货物损失：
- 若物流车在运输过程中因事故导致第三方货物损失，根据《中华人民共和国民法典》第八百三十二条，承运人（即物流公司）对运输过程中货物的毁损、灭失承担赔偿责任。但若能证明货物的毁损、灭失是因不可抗力、货物本身的自然性质或者合理损耗以及托运人、收货人的过错造成的，则不承担赔偿责任。
- 在实际操作中，物流公司通常会为货物购买货运保险。若已投保，则货物损失可通过保险理赔程序获得赔偿。若未投保或保险理赔不足，则物流公司需根据合同约定和法律规定向货主进行赔偿。
人员伤亡赔偿：
- 若事故导致人员伤亡，赔偿问题将更为复杂。除了交强险和商业险的赔付外，还可能涉及工伤赔偿、人身损害赔偿等多个法律领域。此时，应首先由交通部门进行现场勘查、责任认定和赔偿调解。若调解不成，则可通过法律途径解决。
三、赔偿流程与注意事项
及时报案与理赔：
- 事故发生后，应立即向公安机关交通管理部门报案，并通知保险公司进行理赔。同时，保留好相关证据材料，如事故现场照片、货物清单、运输合同等。
协商与调解：
- 在赔偿过程中，双方可首先尝试通过协商或调解解决纠纷。这有助于节省时间和成本，并维护双方的良好关系。
法律途径：
- 若协商或调解不成，则可通过法律途径解决。此时，应咨询专业律师，了解自身权益和诉讼风险，并准备充分的证据材料以支持自己的主张。
挂靠协议的重要性：
- 挂靠人与被挂靠公司之间签订的挂靠协议对责任承担有重要影响。因此，在签订挂靠协议时，应明确双方的权利义务、违约责任以及事故责任承担等条款，以减少后续纠纷。
四、建议与总结
- 加强安全管理：物流公司应加强对挂靠车辆的安全管理，定期检查维护车辆，严格审查驾驶人资质，以降低事故发生风险。
- 完善保险保障：为物流车和货物购买充足的保险，以在事故发生时获得足够的赔偿保障。
- 明确合同约定：在挂靠协议和运输合同中明确责任承担条款，以减少后续纠纷和法律风险。
综上所述，物流车出车祸挂靠公司的赔偿问题涉及多个法律层面和实际操作流程。在处理此类问题时，应综合考虑各种因素，确保责任判定的准确性和公正性，并遵循法律程序和赔偿流程进行操作。