通过协议控制的股东在一定条件下是可以主张股东权利的，但具体情况需根据协议内容、公司章程以及相关法律法规综合判断。以下从不同角度为您详细分析：

1. 协议控制股东的法律地位

协议控制股东，通常指的是通过签订一系列协议（如投票权委托协议、一致行动协议等）来间接控制公司决策或享有公司权益的股东。这类股东虽然可能不直接持有公司股份，但通过协议安排，实际上在公司中享有一定的权利和地位。

• 法律认可：在法律上，只要协议内容合法、不违反公序良俗，且双方意思表示真实，那么这类协议是具有法律效力的。因此，协议控制股东基于合法有效的协议，可以主张相应的权利。

2. 股东权利的行使

股东权利主要包括表决权、分红权、知情权等。协议控制股东能否行使这些权利，取决于协议的具体约定以及公司章程的规定。

• 表决权：如果协议中明确约定了协议控制股东享有表决权，或者通过其他方式（如投票权委托）获得了表决权，那么该股东就有权在公司股东大会上行使表决权。
• 分红权：分红权是股东基于其出资或持股比例享有的分配公司利润的权利。如果协议中约定了协议控制股东享有分红权，或者通过其他方式（如股权收益权转让）获得了分红权，那么该股东就有权要求公司分配利润。
• 知情权：知情权是股东了解公司经营状况、财务状况等信息的权利。协议控制股东如果希望通过行使知情权来了解公司情况，需要看协议中是否有相关约定，以及公司章程是否允许非直接持股股东行使知情权。

3. 可能面临的限制与挑战

尽管协议控制股东在一定条件下可以主张股东权利，但在实际操作中，他们可能会面临一些限制和挑战。

• 协议效力问题：如果协议存在瑕疵（如内容违法、意思表示不真实等），那么协议控制股东的权利主张可能会受到质疑。
• 公司章程限制：公司章程是公司的“宪法”，对公司和股东具有约束力。如果公司章程对非直接持股股东的权利行使有特别限制，那么协议控制股东可能需要遵守这些规定。
• 其他股东反对：在公司决策过程中，如果其他股东对协议控制股东的权利主张表示反对，那么可能会引发股东之间的纠纷和冲突。

4. 法律建议

对于协议控制股东来说，为了更好地维护自己的权益，建议采取以下措施：

• 完善协议内容：在签订协议时，应明确约定双方的权利和义务，特别是关于股东权利行使的条款，以确保协议的有效性和可执行性。
• 了解公司章程：在成为协议控制股东之前，应仔细阅读公司章程，了解其中关于股东权利行使的规定和限制。
• 寻求法律支持：在遇到纠纷或挑战时，应及时寻求专业律师的法律支持，通过法律途径维护自己的权益。

总结来说，通过协议控制的股东在一定条件下是可以主张股东权利的，但具体能否行使以及行使的方式和范围，需要根据协议内容、公司章程以及相关法律法规综合判断。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。