若案件本应属于刑事案件，但公安机关却按照行政处罚处理，这属于法律适用错误，应当及时纠正，依法转为刑事案件处理。以下从不同角度为你详细分析：
从法律程序角度
- 立案审查阶段
- 公安机关在受理案件后，有职责对案件性质进行准确判断。如果初步调查发现案件涉嫌刑事犯罪，就应当按照刑事案件的立案标准进行审查。例如，对于盗窃案件，如果盗窃金额达到当地规定的刑事立案标准（如数额较大，一般为1000元至3000元以上，不同地区标准有差异），就应当立案侦查，而不能以行政处罚了事。
- 若公安机关错误地以行政案件立案处理，当事人可以向公安机关的上级部门或者同级人民检察院提出申诉，要求对案件性质进行重新认定。上级部门或检察院经过审查，认为确实属于刑事案件的，会责令公安机关纠正，或者自行立案侦查。
- 调查取证阶段
- 在行政处罚程序中，公安机关的调查取证范围和深度相对有限。而刑事案件的调查取证要求更为严格和全面，需要收集能够证明犯罪嫌疑人犯罪事实的各种证据，包括物证、书证、证人证言、被害人陈述、犯罪嫌疑人供述和辩解、鉴定意见、勘验、检查、辨认、侦查实验等笔录、视听资料、电子数据等。
- 如果公安机关已经按照行政处罚程序进行了一定的调查取证，但发现案件应属刑事案件，那么之前收集的证据在符合刑事诉讼证据要求的情况下，可以作为刑事案件的证据使用。不过，还需要进一步按照刑事诉讼的标准补充完善证据，例如对证据的合法性、关联性、客观性进行更严格的审查。
- 处理决定阶段
- 行政处罚的种类包括警告、罚款、行政拘留、吊销许可证等，其目的是对违法行为人进行制裁和教育，维护社会管理秩序。而刑事处罚则更为严厉，包括管制、拘役、有期徒刑、无期徒刑、死刑以及罚金、剥夺政治权利、没收财产等，旨在惩罚犯罪、保护社会。
- 一旦确定案件应属刑事案件，公安机关应当撤销原来的行政处罚决定，按照刑事诉讼程序对犯罪嫌疑人采取强制措施，如刑事拘留、逮捕等，并将案件移送人民检察院审查起诉。
从当事人权利保护角度
- 犯罪嫌疑人权利
- 如果案件本应刑事立案却按行政处罚处理，犯罪嫌疑人可能会逃避应有的刑事制裁，这看似对其有利，但实际上也剥夺了其在刑事诉讼中享有的某些权利，如获得辩护的权利、申请取保候审的权利等。而且，一旦后续发现错误并转为刑事案件，犯罪嫌疑人可能会面临更严厉的处罚，因为其之前的逃避行为可能会被视为认罪态度不好。
- 犯罪嫌疑人如果认为自己被错误地按行政案件处理，有权委托律师介入。律师可以帮助犯罪嫌疑人分析案件性质，向公安机关提出异议，维护其合法权益。例如，律师可以收集相关证据，证明案件符合刑事立案标准，要求公安机关依法处理。
- 被害人权利
- 对于被害人来说，如果案件被错误地按行政案件处理，其可能无法获得充分的赔偿和公正的司法救济。行政处罚主要是对违法行为人的制裁，对被害人的赔偿往往有限。而刑事案件中，被害人可以通过提起刑事附带民事诉讼的方式，要求犯罪嫌疑人赔偿其因犯罪行为所遭受的物质损失，包括医疗费、误工费、护理费等。
- 被害人可以向公安机关反映情况，要求对案件重新审查。如果公安机关不予以重视，被害人还可以向人民检察院申请立案监督，请求检察院督促公安机关立案侦查。
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