父子互不干涉协议在法律上一般无效，但具体需根据协议内容及实际情况判断。以下从不同角度为你详细分析：

法律原则角度

1. 身份关系不可约定排除：父子关系属于身份关系，是基于出生这一法律事实而自然形成的，具有强烈的伦理性和法定性。法律上不允许通过协议来排除或改变这种身份关系，以及基于身份关系产生的法定权利和义务。例如，父母对未成年子女有抚养教育的义务，成年子女对父母有赡养扶助的义务，这些义务是法定的，不能通过协议来免除。如果协议中涉及排除这些法定权利和义务的内容，那么该部分内容是无效的。

2. 公序良俗原则：法律维护社会的公序良俗，即公共秩序和善良风俗。父子互不干涉协议如果违背了家庭伦理和社会道德，损害了社会公共利益，那么根据公序良俗原则，该协议也是无效的。比如，协议中约定父子之间完全断绝关系，不再有任何往来和联系，这种约定就违背了家庭伦理和社会道德，是无效的。

协议内容角度

1. 部分内容可能有效：如果协议中不涉及身份关系的排除和法定权利义务的免除，而是就一些具体的事项进行约定，比如父子之间就财产的使用、管理、收益等事项达成协议，且这些约定不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么这部分内容可能是有效的。例如，父子之间约定将某套房产由一方使用，另一方不得干涉，且该房产的产权归属明确，这种约定就是有效的。

2. 整体效力受部分无效影响：如果协议中既包含有效部分，又包含无效部分，那么无效部分不影响有效部分的效力，但是，如果有效部分和无效部分具有牵连关系，或者无效部分的存在使得整个协议的目的无法实现，那么整个协议可能被认定为无效。

实际案例角度

在实际生活中，父子之间签订互不干涉协议的情况并不多见，且这类协议往往因为涉及身份关系和法定权利义务的排除而被认定为无效。例如，曾经有案例中，父子之间签订协议约定断绝父子关系，不再承担赡养和抚养义务，法院最终认定该协议无效，因为违背了法律的强制性规定和公序良俗原则。

建议

1. 谨慎签订协议：父子之间如果因为某些原因需要签订协议，一定要谨慎考虑协议的内容，避免涉及身份关系的排除和法定权利义务的免除。

2. 咨询专业律师：在签订协议前，最好咨询专业律师的意见，确保协议的内容合法有效，避免因为协议无效而引发不必要的法律纠纷。

3. 注重家庭伦理：父子关系是家庭关系的重要组成部分，应该注重维护家庭伦理和社会道德，通过沟通和协商来解决分歧和矛盾，而不是通过签订协议来排除或改变彼此的关系。

如果你有具体的协议内容或者实际情况需要咨询，可以直接向我提问，我会根据你的具体情况给出更详细的法律建议。