在有确权证的耕地上种植大棚，若符合相关法律、规划和政策要求，则不违法；反之，则可能构成违法行为。以下是对此问题的详细分析：

合法性要素

1. 符合土地利用规划：

   • 种植大棚需与当地的土地利用规划相一致，不能随意改变土地的农业用途。确权证是土地合法使用的证明，但种植大棚仍需确保符合规划要求，特别是不能占用永久基本农田进行非农业建设（除非符合特定条件并补划）。

2. 经过相关部门批准：

   • 经营者应与农村集体经济组织签订用地协议，并履行备案手续。备案需向乡镇政府提交，并由其汇总后汇交至县级自然资源主管部门和农业农村主管部门。这是确保大棚建设合法性的重要步骤。

3. 不破坏耕地：

   • 大棚建设应避免对耕地造成不可逆的损害，特别是耕作层。确权证上的耕地是用于农业生产的，种植大棚时应确保不破坏其耕作条件。

4. 遵循设施农用地管理规定：

   • 大棚作为设施农业用地，需遵守使用年限、备案手续等具体要求。不得擅自改变大棚的农业用途，如将其转为住宅、工厂或商业设施。

违法情形

1. 改变土地用途：

   • 若以种植大棚为名，实际用于非农业活动，如居住、工业生产等，则构成“大棚房”问题，属于严重违法。这种行为不仅违反了土地利用规划，也损害了耕地的农业功能。

2. 破坏耕地质量：

   • 在种植大棚过程中，若因建设或管理不当导致土壤质量下降、生态环境破坏，将受到法律制裁。确权证上的耕地是宝贵的农业资源，应得到妥善保护。

3. 未履行审批和备案手续：

   • 未与农村集体经济组织签订用地协议或未向乡镇政府备案，视为违法用地行为。即使拥有确权证，也需按照法定程序进行大棚建设，以确保合法性。

4. 超年限使用或未按规定管理：

   • 超出设施农用地的使用年限或未遵守其他管理规定，同样构成违法行为。大棚建设应遵循相关法规和政策要求，确保合规性和可持续性。

建议与指导

• 详细咨询当地部门：在进行耕地上的大棚种植前，建议详细咨询当地自然资源主管部门和农业农村主管部门，了解具体的土地利用规划和政策要求。
• 确保手续齐全：确保所有审批和备案手续齐全，避免后续的法律风险。与农村集体经济组织签订用地协议，并向乡镇政府备案是必要步骤。
• 严格遵守管理规定：严格遵守设施农用地管理的各项规定，确保大棚种植的合法性和可持续性。不得擅自改变大棚的农业用途或超年限使用。

综上所述，在有确权证的耕地上种植大棚的合法性取决于是否满足一系列法律、规划和政策要求。为确保合法性并避免法律风险，建议在进行大棚种植前详细咨询当地部门并遵循相关法规和政策要求。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。