结论前置：

1. 一般情况下，公安部门不能直接没收因接受虚开抵扣的税款，但可依法追缴税款及滞纳金，并可能对相关责任人进行处罚。
2. 若涉及非法所得，公安部门在刑事诉讼中可依法追缴或责令退赔。

详细分析：

在处理接受虚开抵扣税款的问题时，公安部门的主要职责是调查犯罪行为，并依法将案件移送检察机关审查起诉。对于税款的没收或追缴，通常涉及以下法律程序和规定：

1. 税款的追缴：

   • 根据《中华人民共和国税收征收管理法》的相关规定，对于纳税人接受虚开发票进行抵扣，造成少缴税款的，税务机关有权追缴其不缴或者少缴的税款、滞纳金，并处不缴或者少缴的税款百分之五十以上五倍以下的罚款。
   • 这一过程中，公安部门并不直接参与税款的追缴，而是由税务机关负责执行。

2. 刑事处罚与追缴：

   • 如果接受虚开抵扣税款的行为构成犯罪，如虚开增值税专用发票罪，公安部门将依法进行刑事立案侦查，并将案件移送检察机关审查起诉。
   • 在刑事诉讼过程中，法院会根据犯罪情节判处相应的刑罚，并可能同时判决追缴或责令退赔违法所得。这里的“违法所得”可能包括因接受虚开抵扣而少缴的税款。
   • 公安部门在刑事诉讼中会配合法院的执行工作，但并非直接“没收”税款，而是通过法律程序确保违法所得被追缴或退赔。

3. 没收财产的适用：

   • 没收财产是一种较为严厉的刑罚，通常适用于严重犯罪行为，如贪污罪、受贿罪等。在接受虚开抵扣税款的案件中，除非相关责任人同时犯有其他严重犯罪，否则一般不会直接适用没收财产的刑罚。

行动建议：

• 如果您或您的企业涉及接受虚开抵扣税款的问题，建议立即咨询专业律师，了解具体的法律风险和应对策略。
• 配合税务机关和公安部门的调查工作，如实提供相关证据和信息，以减轻可能的法律责任。
• 在未来的经营活动中，严格遵守税收法律法规，避免涉及任何虚开发票或偷逃税款的行为。