公司与会计签订注销公司的协议是否有效，需视具体情形而定。以下从不同角度进行详细分析：

一、协议签订主体合法性

1. 公司注销前签订：

   • 若协议是在公司注销登记前签订的，且公司具备合法的民事主体资格，那么该协议一般是有效的。公司注销前的债权债务会依法进行清算，合同相对方可以要求公司权利义务的承继者履行协议。

2. 公司注销后签订：

   • 若协议是在公司注销后签订的，且以原公司名义签订，则构成无权代理。此时，协议效力待定。若原公司股东等被代理人追认此协议，那么协议有效；若被代理人不追认，协议则无效。

二、协议内容合法性

1. 不存在法定无效事由：

   • 协议若不存在法定无效事由，如一方以欺诈、胁迫的手段订立，损害国家利益；恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益；以合法形式掩盖非法目的；损害社会公共利益；违反法律、行政法规的强制性规定等，则协议有效。

2. 存在法定无效事由：

   • 若协议存在上述法定无效事由之一，则协议无效。例如，若协议内容违反了法律、行政法规的强制性规定，或者损害了社会公共利益，那么该协议将被认定为无效。

三、协议履行情况

1. 协议已履行完毕：

   • 若协议所涉事项已履行完毕或不存在遗留问题，那么协议的效力可能随公司主体的消灭而归于消灭，但不影响之前已经履行的部分的有效性。

2. 协议存在未履行事项：

   • 若协议存在未履行事项，且公司注销后其权利义务由特定的继受主体承接，那么该继受主体应按照协议约定履行义务。此时，协议依然有效。若继受主体拒绝履行，合同相对方可以通过法律途径追究其责任。

四、特殊情形下的协议效力

1. 协议义务具有持续性：

   • 若协议约定的义务具有持续性，即便公司注销，基于诚实信用原则，相关方仍可能有继续履行的责任。例如，长期服务合同或租赁合同等。

2. 公司注销存在违法违规行为：

   • 若公司注销存在违法违规行为，导致债权人利益受损，那么相关协议可能会因损害债权人利益而被认定部分或全部无效。此时，债权人可通过法律途径追究相关责任人的责任。

法律建议

• 签订协议前：务必确认公司的民事主体资格是否合法有效，避免与公司注销后签订协议。
• 协议内容审查：仔细审查协议内容，确保不存在法定无效事由，并明确双方的权利义务。
• 协议履行监督：在协议履行过程中，密切关注公司的经营状况和注销进展，确保协议能够顺利履行。
• 法律救济途径：若协议履行过程中出现争议或问题，及时通过法律途径解决，维护自身合法权益。

举例说明：假设某公司与会计签订了一份注销公司的协议，但在协议履行过程中公司突然注销。此时，若协议是在公司注销前签订的，且不存在法定无效事由，那么该协议仍然有效。合同相对方可以要求公司权利义务的承继者（如股东）继续履行协议。若承继者拒绝履行，合同相对方可以通过法律途径追究其责任。

综上所述，公司与会计签订注销公司的协议是否有效，需结合协议签订主体合法性、协议内容合法性、协议履行情况以及特殊情形下的协议效力等多方面因素进行全面考量。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。