公司注销后盖章的协议，其效力需根据具体情况来判断，一般情况下无效，但特殊情况下可能有效。以下是对此问题的详细分析：
一、公司注销对协议效力的基本影响
公司法人资格的终止：
- 公司注销意味着公司法人资格的终止，即公司在法律上不再存在。法人资格终止后，公司无法再以其名义从事任何民事活动，包括签订协议。
协议主体的缺失：
- 协议是双方或多方当事人之间设立、变更、终止民事权利义务关系的协议。当一方当事人（如公司）已经不存在时，协议就失去了一个必要的主体，导致协议无法继续履行或产生法律效力。
印章的失效：
- 公司注销后，其公章等印章应依法上缴或销毁，不得再使用。使用已注销公司的印章签订的协议，在法律上可能被视为无效协议。
二、特殊情况下协议可能有效的情形
清算过程中的协议：
- 如果公司在注销前正在进行清算程序，并且清算组以公司名义与他人签订了协议，且该协议符合清算目的和法律规定，那么该协议可能仍然有效。但这种情况下，协议的效力取决于清算组的权限和清算程序的合法性。
表见代理或善意相对人的保护：
- 如果相对人有理由相信行为人有代理权（如表见代理），或者相对人是善意的且无过失地信赖了已注销公司的印章或代表人的行为，那么根据法律规定，可能会保护相对人的利益，认定协议有效或部分有效。这要求存在使相对人相信行为人具有代理权的事实或理由，相对人主观上为善意且无过失，并且无权代理人的代理行为在形式上符合法律行为要件。在此情况下，为保护交易安全和善意相对人的利益，法律会认可盖章行为的效力，并由公司股东或相关责任主体承担相应后果。
对注销前行为的确认：
- 若盖章行为是对公司注销前已存在的权利义务关系的确认，且不违反法律法规强制性规定，则该确认行为可能具有法律效力。例如，公司注销前与供应商存在未结清货款，注销后通过盖章出具还款承诺，这是对之前债务的一种合法确认，符合法律规定和双方真实意思表示时，盖章确认具备相应的法律效力。
三、法律建议
对于公司注销前已签订且尚未履行完毕的协议：
- 清算组应根据清算情况决定是继续履行还是终止履行未完成的协议。若决定继续履行，则由清算中的企业承担相关权利义务；若决定终止，则需赔偿对方因此遭受的损失。
- 原企业的股东、出资人等清算义务人在未依法履行清算义务导致债权人利益受损时，需承担相应的民事责任。
对于公司注销后新签订的协议：
- 一般情况下，公司注销后新签订的协议无效。为避免法律风险，建议在公司注销后严格遵循相关法律法规，妥善处理公司公章，不再使用已注销公司的印章签订任何协议。
- 若因特殊情况（如表见代理）导致协议被认定有效，相关责任主体需承担相应后果。因此，在涉及公司注销后的协议签订时，务必谨慎行事，确保所有行为均符合法律规定。
争议解决：
- 若因公司注销导致协议无法履行或产生纠纷，相关方可依据协议约定和法律规定，通过协商、诉讼等方式解决争议。在处理此类问题时，建议咨询专业律师以获取准确的法律意见和帮助。
综上所述，公司注销后盖章的协议效力需根据具体情况判断。在处理此类问题时，应充分考虑协议的具体内容、签订时间以及相关法律法规的规定，以确保合法权益得到妥善保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。