单位对已退还3万元贪污贿赂款的非公职人员，通常可采取内部纪律处分或解除劳动关系，若涉嫌犯罪将移送司法机关处理。具体分析如下：

1. 内部纪律处分
   根据《劳动合同法》第三十九条，劳动者严重违反用人单位规章制度的，单位可解除劳动合同。若单位规章制度明确将“收受贿赂”列为严重违纪行为（如金额达到3万元即构成），即使行为人已退还款项，单位仍可依据制度给予警告、记过、降职等处分，甚至直接解除劳动合同。
   关键点：需证明单位规章制度已通过民主程序制定、公示且内容合法，否则处分可能被认定为违法。

2. 解除劳动关系
   若贿赂行为损害单位利益（如商业贿赂导致合同无效、造成经济损失等），单位可依据《劳动合同法》第三十九条第二项“严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害”解除合同。此时需举证损害结果与贿赂行为的因果关系，例如：因收受贿赂导致单位被行政处罚、合同违约赔偿等。

3. 移送司法机关（若涉嫌犯罪）
   根据《刑法》第一百六十三条，非国家工作人员受贿罪的立案标准为6万元以上。若行为人收受3万元后主动退还，可能因“未遂”或“情节轻微”不构成犯罪，但若存在多次受贿、利用职务便利为他人谋利等情节，仍可能被追究刑事责任。单位发现犯罪线索后，应向公安机关报案，由司法机关调查处理。

4. 民事赔偿与追偿
   若贿赂行为导致单位经济损失（如因行贿方违约造成的损失），单位可依据《民法典》第一百八十六条要求行为人赔偿。若行为人已退还贿赂款，单位可主张赔偿实际损失（如差价、违约金等），但需提供充分证据证明损失金额。

建议行动步骤：

1. 核查单位规章制度是否明确禁止受贿行为及处分标准；
   
2. 收集贿赂行为证据（如转账记录、证人证言、退还凭证等）；
   
3. 评估损害后果（如经济损失、商业信誉损失等）；
   
4. 根据情节轻重选择内部处分或解除合同，必要时咨询律师完善程序；
   
5. 若涉嫌犯罪，及时向公安机关报案并配合调查。
   

如有进一步细节（如行为人职位、贿赂用途、单位类型等），可提供更多信息以便更精准分析。