关于借款合同中约定违约金为日千分之五是否合法的问题，结论如下：
该违约金标准可能过高，存在被法院调整的风险
根据《民法典》第五百八十五条及司法实践，违约金需以实际损失为基础，一般不得超过损失的30%。若按日千分之五（年化约182.5%）计算，远超民间借贷利率上限（合同成立时一年期LPR的四倍，当前约15.4%），也远超实际损失的合理范围，法院可能依申请予以调减。
具体合法性需结合实际损失判断
- 若出借人实际损失较低（如仅资金占用损失），日千分之五的违约金可能被认定为“过分高于损失”，法院会调整至合理范围（如LPR四倍以内）。
- 若借款人违约导致出借人产生高额损失（如交易机会丧失、额外融资成本等），且能提供证据证明，则违约金可能被部分支持，但仍需受“不超过损失30%”的限制。
法律背景与建议：
违约金调整规则
- 法律依据：《民法典》第五百八十五条明确，违约金低于损失可增加，过高可减少。
- 司法实践：法院会综合考量合同履行情况、过错程度、预期利益等因素，以实际损失为基准调整违约金。例如，若出借人仅主张利息损失，法院可能将违约金调整至与利息总和不超过LPR四倍的水平。
民间借贷的特殊限制
- 利率上限：根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》，出借人主张的逾期利息、违约金、其他费用总和不得超过合同成立时一年期LPR的四倍。超出部分，法院不予支持。
- 示例计算：
假设合同成立时一年期LPR为3.85%，则四倍为15.4%（年化）。若借款10万元，按日千分之五计算，年违约金达18.25万元，远超15.4%的合法上限（约1.54万元/年）。此时，法院可能将违约金调减至合法范围内。
实务建议
- 对出借人：
- 避免约定过高违约金，增加被调减风险。
- 保留实际损失证据（如融资成本、交易机会丧失证明等），以支持违约金主张。
- 对借款人：
- 若认为违约金过高，可向法院申请调减，并提供实际损失较低的证据（如出借人未产生额外损失）。
- 签订合同时，可要求明确违约金计算方式，避免模糊条款。
总结：日千分之五的违约金标准在司法实践中大概率被认定为过高，法院会依申请调整至合理范围。建议借贷双方在合同中明确违约金与实际损失的关联性，并遵守民间借贷利率上限规定，以降低纠纷风险。如有具体案件，可进一步提供细节，我会为您详细分析。