请假扣加班工资是否违法，需根据具体情况来分析，以下是详细说明：
请假扣未发生的加班费不违法
- 加班费是劳动者在正常工作时间之外提供额外劳动所获得的报酬。若员工请假导致其原本可能获得加班费的加班安排取消，即未实际进行加班工作，用人单位不支付这部分未发生的加班费，并不违法。因为加班费的支付以实际发生加班行为为前提，若无加班事实，则不存在支付加班费的义务。简言之，员工未加班，用人单位无需支付加班费。
请假扣已发生的加班费违法
- 如果员工已经完成了加班工作，且用人单位已经确定了加班费的数额，此时员工请假，用人单位却扣除其已经产生的加班费，这种做法是违法的。依据《中华人民共和国劳动法》等法律法规，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。加班费属于工资的组成部分，员工通过加班已经获得了相应加班费的权益，用人单位无正当理由扣除已确定的加班费，即构成克扣工资的违法行为。
- 实例说明：例如，小李上个月加班获得了1000元加班费，这个月因私请假几天，公司却以其请假为由扣除了他上个月的加班费。公司的这种行为违反了《中华人民共和国劳动法》，小李有权通过与公司协商、向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁等方式，来维护自己的合法权益。
特殊情况说明
- 值得注意的是，如果是工作日加班后请假，公司可根据内部规章制度合理扣除部分工资，但扣除的工资不得低于当地最低工资标准。在此情况下，适当扣除部分加班费也可能被视为合理。但最终是否违法，还需结合公司规定与实际情况综合判断。
建议：
- 作为员工，如果遇到公司违法扣除加班费的情况，应首先与公司进行协商，尝试解决问题。
- 如果协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
- 在整个过程中，保留好相关的证据，如加班记录、工资条等，以便在需要时提供证明。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。