发票被抵扣后，销售方仍然有权起诉购买方以追讨欠款。以下是对此问题的详细解答：

一、发票抵扣与付款义务的关系

发票抵扣是税务上的一个环节，它允许纳税人在计算应纳税额时，将进项税额从销项税额中抵扣。然而，这并不意味着抵扣后购买方就可以免除付款义务。付款是合同上的明确义务，购买方必须按照合同约定支付货款给销售方。因此，发票抵扣与付款义务是两个独立的概念，互不影响。

二、法律依据

1. 《中华人民共和国增值税暂行条例》第八条：该法条明确规定了纳税人购进货物、劳务等支付的增值税额可以从销项税额中抵扣，但并未说明抵扣后即可不付款。

2. 《中华人民共和国民法典》第五百七十七条：该法条规定了当事人一方不履行合同义务或履行合同义务不符合约定的，应承担违约责任。这为销售方在购买方未履行付款义务时提起诉讼提供了法律依据。

三、起诉前的准备工作

1. 收集证据：

   • 保留好已抵扣的发票原件或复印件，以及与发票开具、交易相关的其他凭证，如交易合同、送货单、对账单等。
   • 收集购买方未按时履行付款义务的通知、相关聊天记录等违约证据。

2. 确定诉讼主体：明确起诉方（销售方）和被起诉方（购买方）的基本信息，包括名称、住所地、法定代表人等。

3. 撰写诉状：诉状应包含原被告信息、诉讼请求、事实与理由、证据和证据来源等。诉讼请求应清晰、准确，如要求购买方支付货款及违约金等。

4. 确定管辖法院：根据法律规定和双方合同约定来确定有管辖权的法院，一般由被告住所地或合同履行地法院管辖。

四、诉讼流程

1. 提交诉状：将诉状及相关证据一式多份提交至有管辖权的人民法院。

2. 法院受理：法院对提交的材料进行形式审查，符合立案条件的，予以受理并通知缴纳诉讼费。

3. 开庭审理：

   • 双方出庭陈述各自的主张，进行举证、质证。
   • 围绕证据的真实性、合法性、关联性发表意见。

4. 调解与判决：

   • 法院可能组织双方进行调解，若达成一致，签订调解协议，由法院出具调解书。
   • 若调解不成，法院根据审理情况作出判决。

五、后续执行与建议

1. 执行：若购买方不履行生效判决或调解书确定的义务，销售方可向法院申请强制执行，以实现自身权益。

2. 协商解决：在提起诉讼前，建议双方先尝试通过协商解决纠纷，以节省时间和成本，维护双方关系。

3. 寻求专业帮助：如销售方对法律程序不熟悉，可咨询专业律师，获取专业的法律意见和指导。

综上所述，发票被抵扣后，销售方仍有权起诉购买方以追讨欠款。在起诉过程中，销售方应做好充分的准备工作，遵循法律程序进行操作，以确保自身合法权益得到有效维护。