关于员工保密协议书中的违约金起诉是否有效以及如何撰写的问题，这确实是一个涉及法律细节和实际操作的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、保密协议书中违约金起诉的有效性
保密协议书中约定的违约金，其起诉的有效性并非一概而论，而是需要根据具体情况来判断。根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律规定，我们可以得出以下结论：
一般原则：
- 单纯的保密协议，即仅约定员工对用人单位的商业秘密负有保密义务，而不涉及竞业限制的，其约定的违约金条款通常会因违反法律强制性规定（如《劳动合同法》第二十五条）而被认定无效。
特殊情况：
- 如果保密协议中包含了竞业限制条款，即员工在离职后一定期限内不得从事与用人单位有竞争关系的工作或业务，那么用人单位可以与员工约定违约金。在这种情况下，如果员工违反竞业限制约定，用人单位有权起诉要求员工支付违约金，且该起诉通常是有效的。
协议内容的合法性与公平性：
- 即使保密协议中包含了竞业限制条款，其违约金条款的有效性还需考虑协议内容的合法性和公平性。如果违约金过高或存在其他不公平、不合理的条款，可能会被法院或仲裁机构调整或认定无效。
二、如何撰写保密协议书中的违约金条款
在撰写保密协议书中的违约金条款时，应确保条款内容合法、合理且明确，以下是一些建议：
明确保密义务和竞业限制：
- 在协议中清晰界定员工需要保密的信息范围，以及是否涉及竞业限制。如果涉及竞业限制，应明确限制的期限、地域和行业范围。
合理约定违约金数额：
- 违约金的数额应基于违约可能造成的损失、保密信息的重要性及违约可能获得的利益等因素合理确定。避免约定过高或过低的违约金，以免引发纠纷或被法院调整。
明确违约金的支付方式和时间：
- 在协议中约定违约金的支付方式（如一次性支付或分期支付）和支付时间（如违约行为发生后的一定期限内）。
确保条款的合法性和公平性：
- 确保协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益。同时，确保条款对双方公平合理，避免显失公平的情况。
示例条款：
- “若乙方（员工）违反本协议约定的保密义务或竞业限制义务，应向甲方（用人单位）支付违约金人民币XX元。违约金应在违约行为发生后XX日内支付至甲方指定账户。”
三、实际操作建议
咨询专业法律人士：
- 在撰写保密协议书前，建议咨询专业法律人士或律师，以确保协议内容的合法性和有效性。
双方充分沟通协商：
- 在签订保密协议书前，双方应充分沟通协商，确保对协议内容有共同的理解和认可。
保留相关证据：
- 在协议履行过程中，双方应保留相关证据（如保密信息的交接记录、竞业限制的就业证明等），以便在发生纠纷时提供证明。
综上所述，保密协议书中的违约金起诉的有效性取决于协议内容的合法性和具体情况。在撰写违约金条款时，应确保条款内容合法、合理且明确，并在签订前咨询专业法律人士以避免后续纠纷。