员工保密协议书在出现纠纷时是可以起诉的，但具体起诉流程和条件需根据纠纷的性质以及相关法律法规来确定。以下是对此问题的全面分析：
保密协议的可诉性
- 保密协议作为劳动合同的一项补充协议或从属协议，具有法律效力。根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十三条，用人单位与劳动者可以约定保守商业秘密和与知识产权相关的保密事项。因此，当保密协议的一方违反约定，如擅自披露或不当使用保密信息，给另一方造成损失时，守约方有权寻求法律救济，包括通过起诉来维护自身权益。
起诉的具体情形
- 对方违约：若员工违反保密协议的约定，如泄露公司商业秘密，用人单位可以向法院提起诉讼，要求员工承担违约责任，包括继续履行保密义务、支付违约金、赔偿损失等。
- 协议效力争议：当双方对保密协议的效力产生分歧，如认为协议存在欺诈、胁迫、显失公平等可撤销事由，或因违反法律法规强制性规定而无效时，任何一方都可以通过起诉请求法院对协议的效力进行认定。
起诉的条件与流程
起诉条件：
- 原告必须是与保密协议有直接利害关系的公民、法人或其他组织，如用人单位或员工本人。
- 有明确的被告，即清楚知道起诉的对象及其相关信息，如员工的姓名、身份证号码等。
- 有具体的诉讼请求和事实、理由，详细说明诉讼目的及依据，如要求员工支付违约金的具体金额和理由。
- 属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖，如保密协议纠纷属于劳动争议范畴的，应向有管辖权的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁结果不服的再向法院起诉。
特殊流程（劳动争议范畴）：
- 若保密协议纠纷涉及雇主与员工之间的劳动争议，应先尝试协商或调解，以寻求双方都能接受的解决方案。
- 协商或调解不成时，可向劳动监察大队投诉或向劳动仲裁委员会申请仲裁，由劳动仲裁机构对纠纷进行裁决。
- 对仲裁结果不服的，方可向人民法院提起诉讼，由法院对纠纷进行最终裁决。
一般流程（民事争议范畴）：
- 若纠纷涉及雇主之间或非员工与雇主之间的问题，属于民事争议范畴，可直接向法院起诉，由法院根据民事诉讼程序进行审理和裁决。
保密协议的法律效力与违约责任
- 保密协议一旦签订，即具有法律约束力。双方应严格遵守协议约定的保密义务，不得擅自披露或不当使用保密信息。
- 如一方违约，需按约定承担违约责任，包括但不限于继续履行、采取补救措施、支付违约金或赔偿损失等。违约金的金额和赔偿损失的范围应根据协议约定和实际情况进行确定。
建议与提醒：
- 在签订保密协议时，双方应明确保密信息的范围、保密期限、保密义务以及违约责任等条款，以避免后续纠纷的发生。
- 若发生保密协议纠纷，双方应首先尝试通过协商或调解解决纠纷，以减少不必要的法律成本和时间成本。
- 若协商无果，则可依法向法院提起诉讼或向劳动仲裁委员会申请仲裁，维护自身合法权益。在起诉或申请仲裁前，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。
如有任何关于保密协议或劳动工伤方面的法律问题，欢迎直接向我咨询。