结论：拖欠工资两年，劳动者是否能申请劳动仲裁，主要取决于劳动关系是否存续以及是否存在时效中断、中止的情形。以下分情况详细说明：
劳动关系存续期间
- 不受时效限制：根据《劳动争议调解仲裁法》及相关规定，如果劳动关系仍然存续，因拖欠劳动报酬发生争议，劳动者申请仲裁不受一年仲裁时效期间的限制。这意味着，即使工资被拖欠两年，劳动者也有权随时提起仲裁申请，以维护自己的合法权益。
劳动关系终止后
- 一年内提出申请：如果劳动关系已经终止，劳动者需要在劳动关系终止之日起一年内提出仲裁申请。超过这一时限，仲裁时效可能已过，劳动者将失去通过仲裁途径追讨工资的权利。不过，如果存在时效中断或中止的情形，这一时限可能会重新计算或延长。
时效中断与中止
- 时效中断：在拖欠工资期间，如果劳动者曾向用人单位主张过权利（如书面、邮件、短信等方式讨要工资），或向有关部门请求过权利救济（如向劳动监察部门投诉），或用人单位同意履行支付义务，仲裁时效会从中断时起重新计算。这意味着，即使拖欠时间超过两年，劳动者仍有可能在时效中断后的一年内申请仲裁。
- 时效中止：若因不可抗力或其他正当理由（如劳动者突发重大疾病等），导致劳动者无法在规定的仲裁时效期间内申请仲裁，仲裁时效可能会中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。
实际操作建议：
- 收集证据：劳动者在申请仲裁前，应尽可能收集能证明劳动关系、工资标准及拖欠事实的证据，包括但不限于劳动合同、工资条、考勤记录、工作沟通记录等。这些证据对于仲裁的成功至关重要。
- 及时行动：无论劳动关系是否存续，劳动者都应尽快采取行动，以免因超过时效而丧失仲裁权利。特别是在劳动关系终止后，更应抓紧时间在一年内提出仲裁申请。如果存在时效中断或中止的情形，也应及时了解并利用这些情形来维护自己的权益。
法律后果：
- 如果劳动者在有效时效内申请仲裁并胜诉，用人单位将被要求支付拖欠的工资及可能的赔偿金。
- 如果劳动者超过时效申请仲裁或未能提供充分证据支持其主张，可能会面临仲裁请求被驳回的风险。
综上所述，拖欠工资两年是否还能申请劳动仲裁，需根据具体情况判断。劳动者应充分了解相关法律规定，及时采取措施保护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。