结论：因工伤二次新伤，即使医院已经开出医嘱，是否需要申请停工留薪期，取决于具体情况。如果二次新伤导致需要暂停工作接受治疗，那么应当申请停工留薪期；如果二次新伤并未影响工作能力，或者医嘱并未要求暂停工作，那么可能无需申请。

分析说明：

1. 停工留薪期的定义与目的：

   • 停工留薪期是指职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的期间。其目的在于保障职工在工伤治疗期间的基本生活，并为其提供必要的医疗和康复条件。

2. 二次新伤与停工留薪期的关系：

   • 如果二次新伤是由于工伤导致的，且该新伤需要职工暂停工作接受治疗，那么根据停工留薪期的定义，职工应当有权申请停工留薪期。
   • 医嘱是医生根据职工的病情和治疗需要给出的专业建议。如果医嘱中明确要求职工暂停工作以接受治疗，那么这通常意味着职工需要停工留薪期。

3. 申请停工留薪期的流程与注意事项：

   • 申请流程：职工在发生工伤后，应及时向用人单位报告，并按照用人单位的要求提供相关的医疗证明和诊断书。如果需要申请停工留薪期，职工应向用人单位提出书面申请，并附上医生的医嘱和诊断书等证明材料。
   • 注意事项：
     • 职工应确保提供的医疗证明和诊断书真实有效，且能够充分证明其需要暂停工作接受治疗的事实。
     • 用人单位在收到职工的申请后，应及时进行审核，并根据实际情况决定是否批准停工留薪期。如果用人单位拒绝批准或未在规定时间内给予答复，职工可以向劳动保障行政部门投诉或申请劳动仲裁。

4. 无需申请停工留薪期的情况：

   • 如果二次新伤并未影响职工的工作能力，或者医嘱并未要求职工暂停工作接受治疗，那么职工可能无需申请停工留薪期。在这种情况下，职工可以继续正常工作，并按照用人单位的规定享受相应的工伤保险待遇。

行动建议：

• 对于职工：如果因工伤导致二次新伤且需要暂停工作接受治疗，应及时向用人单位提出停工留薪期的申请，并附上医生的医嘱和诊断书等证明材料。同时，应保留好所有相关的医疗证明和诊断书，以备后续需要。
• 对于用人单位：在收到职工的停工留薪期申请后，应及时进行审核，并根据实际情况决定是否批准。如果拒绝批准或未在规定时间内给予答复，应承担相应的法律责任。

法律背景：

• 根据《工伤保险条例》的相关规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这为职工在工伤治疗期间提供了必要的法律保障。