结论：合同款仲裁后对方打回来了，是否需要开票取决于双方合同中的约定以及相关法律法规的规定。一般来说，如果合同中有明确约定需要开具发票，或者按照交易习惯或相关法律规定应当开具发票的，那么即使款项已经通过仲裁方式追回，收款方仍然需要开具发票。
分析说明：
合同约定：
- 如果双方在合同中明确约定了收款方在收到款项后需要开具发票，那么这一约定对双方均具有约束力。无论款项是通过何种方式（包括仲裁）追回的，收款方都应当按照合同约定开具发票。
交易习惯：
- 在商业实践中，开具发票是交易过程中的一个重要环节，它不仅是收款方履行纳税义务的证明，也是付款方进行财务报销和税务抵扣的依据。因此，如果按照行业交易习惯或双方以往的交易模式，收款方在收到款项后应当开具发票的，那么这一习惯或模式同样适用于仲裁后款项追回的情况。
相关法律规定：
- 根据《中华人民共和国发票管理办法》等相关法律法规的规定，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票。这一规定并不因款项是通过仲裁方式追回而有所改变。因此，如果收款方在收到仲裁追回的款项后未开具发票，可能面临税务部门的处罚。
特殊场景：
- 如果双方在合同中并未明确约定需要开具发票，且按照交易习惯或相关法律规定也不应当开具发票的（如某些非经营性交易或免税交易），那么收款方在收到仲裁追回的款项后可能无需开具发票。但这种情况较为少见，且需要具体分析合同内容和相关法律法规的规定。
后续行动建议：
- 核对合同条款：首先，建议收款方仔细核对合同中的相关条款，明确双方关于开具发票的约定。
- 咨询税务部门：如果合同条款不明确或存在争议，建议收款方咨询当地税务部门或专业税务律师的意见，以了解具体的税务处理方式和可能面临的法律责任。
- 及时开具发票：如果根据合同约定、交易习惯或相关法律规定应当开具发票的，收款方应当及时开具并交付给付款方，以避免可能的税务风险和法律纠纷。
法律后果：
- 如果收款方未按照合同约定、交易习惯或相关法律规定开具发票的，可能面临税务部门的处罚，包括但不限于罚款、滞纳金等。同时，付款方也可能因此无法进行财务报销和税务抵扣，从而给双方带来不必要的经济损失和法律风险。
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