针对您提出的问题“车主把车卖了有补办登记证书违法吗以及如何处理”，以下是我的详细解答：

一、关于是否违法

车主在车辆出售后，如果原机动车登记证书丢失或损毁，想要补办登记证书本身并不违法。但关键在于，补办登记证书的动机和后续行为。如果车主补办登记证书是为了进行非法活动，如欺诈、盗用车辆信息等，那么这种行为就是违法的。然而，如果车主仅仅是因为丢失或损毁而需要补办，且后续行为合法合规，那么这种行为是合法的。

二、关于如何处理

1. 了解补办条件：

   • 机动车需在本市登记；
   • 机动车未达到或超过国家强制报废标准；
   • 提交法律法规规定的申请材料；
   • 如果机动车所有人为个人，且办理补领业务，应本人到场申请，不能委托他人代理（除非因死亡、出境、重病残和不可抗力等原因不能到场，此时需出具有关证明并委托他人代理或由继承人申请）。

2. 准备申请材料：

   • 机动车所有人的身份证明；
   • 如果属于换领《机动车登记证书》且由代理人代理的，还需提交代理人身份证明及机动车所有人的书面委托（或通过“交管12123”手机APP申请网上委托）；
   • 如果机动车所有人因特殊原因不能到场，需提交有关证明和代理人或继承人的身份证明；
   • 如果车辆是被依法没收、拍卖、仲裁裁决或法院调解、裁定、判决所有权转让，且原机动车所有人未提供机动车登记证书的，现机动车所有人需提交相关协助执行通知书或证明。

3. 前往办理地点：

   • 根据车辆类型和所有人身份，选择合适的车管所或车管分所进行办理。

4. 遵循办理流程：

   • 提交申请材料；
   • 车管所受理并审核；
   • 符合规定的，收存相关资料并录入信息；
   • 制作并发放机动车登记证书。

5. 注意事项：

   • 补领、换领机动车登记证书的，原机动车登记证书作废，不得继续使用；
   • 办理时限通常为一个工作日，且需缴纳一定的工本费（如10元/证）。

三、特殊情况处理

如果车辆在转出期间需要补办登记证书，车主需要先回车辆转出地车管所补办登记证书，再申请对应的车辆转出业务。如果车辆属于被依法没收、拍卖等特殊情况，且原机动车所有人未提供机动车登记证书的，现机动车所有人在办理转让登记时，需按照相关规定提交协助执行通知书或证明，并由车管所公告原机动车登记证书作废后补发新的登记证书。

综上所述，车主在车辆出售后补办登记证书本身并不违法，但需确保补办动机合法且后续行为合规。在处理过程中，车主应了解补办条件、准备申请材料、选择合适的办理地点并遵循办理流程。如有特殊情况，需按照相关规定进行特殊处理。