在行政处罚申请强制执行时发现被处罚人仍在违法的，行政机关可采取以下措施，具体分情况说明如下：

1. 立即采取新的行政处罚措施
   若发现被处罚人仍在实施违法行为，行政机关可依据《行政处罚法》第三十六条，对新的违法行为重新立案调查，并依法作出新的行政处罚决定。例如，若原处罚针对的是“未取得许可证经营”，而强制执行期间发现其仍在无证经营，行政机关可再次作出罚款、责令停业等处罚。
   法律依据：《行政处罚法》第三十六条“违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚；涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，上述期限延长至五年。法律另有规定的除外。前款规定的期限，从违法行为发生之日起计算；违法行为有连续或者继续状态的，从行为终了之日起计算。”

2. 申请法院合并执行或中止原执行程序

   • 合并执行：若新违法行为与原处罚事项存在关联性（如同一违法主体、同一违法类型），行政机关可向法院申请将新处罚与原处罚合并执行，避免重复申请程序。
     
   • 中止执行：若原处罚因被处罚人提出复议或诉讼而中止，且新违法行为可能影响原处罚的合法性，行政机关可申请法院中止原执行程序，待新违法行为处理完毕后再恢复执行。
     法律依据：《行政强制法》第三十九条“有下列情形之一的，中止执行：（一）当事人履行行政决定确有困难或者暂无履行能力的；（二）第三人对执行标的主张权利，确有理由的；（三）执行可能造成难以弥补的损失，且中止执行不损害公共利益的；（四）行政机关认为需要中止执行的其他情形。”

3. 追究拒不执行行政处罚的刑事责任
   若被处罚人通过隐藏财产、转移资产等方式逃避执行，且情节严重（如造成重大损失或社会影响），行政机关可依据《刑法》第三百一十三条，以“拒不执行判决、裁定罪”向公安机关移送案件，追究其刑事责任。
   法律依据：《刑法》第三百一十三条“对人民法院的判决、裁定有能力执行而拒不执行，情节严重的，处三年以下有期徒刑、拘役或者罚金；情节特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。”

4. 申请法院采取更严厉的强制措施
   行政机关可向法院申请对被处罚人采取查封、扣押、冻结财产等强制措施，或直接强制拆除违法建筑、恢复原状等。若被处罚人仍不配合，法院可依法对其采取拘留、罚款等司法强制措施。
   法律依据：《行政强制法》第十二条“行政强制执行的方式：（一）加处罚款或者滞纳金；（二）划拨存款、汇款；（三）拍卖或者依法处理查封、扣押的场所、设施或者财物；（四）排除妨碍、恢复原状；（五）代履行；（六）其他强制执行方式。”

实务建议：

• 行政机关在申请强制执行前，应充分调查被处罚人的财产状况和违法事实，确保执行依据充分；
  
• 若发现新违法行为，建议同步启动新处罚程序，并与法院沟通协调执行方案；
  
• 对拒不执行且情节恶劣的案件，及时移送刑事追究，形成震慑效果。
  

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