当行政处罚程序违法时，处理方式主要取决于违法程度及其对当事人权益的影响。以下是具体分析和处理建议：

1. 程序轻微违法但未影响实体权利
   若程序存在瑕疵（如未书面告知听证权利、未在法定期限内送达文书等），但未实质剥夺当事人陈述、申辩或救济权，且处罚结果合法合理，法院可能认定程序违法但维持处罚结果。此时，行政机关可通过补正程序（如补发通知、说明理由）消除瑕疵，无需撤销处罚。

2. 程序严重违法且损害当事人权益
   若程序违法导致当事人无法有效行使权利（如未依法举行听证、未告知复议或诉讼途径），或处罚结果缺乏关键证据支持，法院通常会撤销处罚决定。此时，行政机关需重新启动合法程序，重新调查取证并作出处罚。

3. 程序违法与实体违法并存
   若行政处罚同时存在程序违法和事实认定错误、法律适用错误等实体问题，法院会直接撤销处罚决定，并可能责令行政机关重新调查。例如，未依法取证导致证据不足，或错误适用法律条款。

具体处理步骤：

• 当事人救济途径：

  • 收到处罚决定后60日内申请行政复议，或6个月内直接提起行政诉讼，主张程序违法并要求撤销处罚。
    
  • 若行政机关未主动纠正，可向其上级部门或监察机关投诉程序违规问题。
    

• 行政机关补救措施：

  • 发现程序违法后，可自行撤销原处罚并重新作出合法决定（如补正听证程序后重新听证）。
    
  • 若已进入诉讼阶段，可与当事人协商和解，或通过法院调解结案。
    

法律依据：

• 《行政处罚法》第38条：违反法定程序构成重大且明显违法的，行政处罚无效。
  
• 《行政诉讼法》第70条：行政行为违反法定程序的，法院判决撤销或部分撤销，并可责令重新作出行政行为。
  

建议：
若您遇到此类情况，建议先通过书面形式向行政机关提出异议，要求其说明程序合法的依据；若未获回应，再通过复议或诉讼途径维权。具体操作需结合处罚类型（如罚款、吊销执照等）和违法情节严重程度分析，您可直接向我咨询细节。