结论：拿了施工单位一万块钱被甲方查出来，这一行为可能涉及违法甚至犯罪，具体后果取决于款项的性质及行为的具体情形。以下从不同角度进行分析：
一、款项性质分析
若款项为施工单位合法财产：
- 法律后果：你未经允许拿走施工单位的一万块钱，可能构成盗窃罪或侵占罪（取决于你是否具有保管、管理该款项的职责）。盗窃罪是指以非法占有为目的，秘密窃取数额较大的公私财物的行为；侵占罪则是指以非法占有为目的，将代为保管的他人财物非法占为己有，数额较大，拒不退还的行为。
- 建议：立即归还该款项，并向施工单位道歉，争取取得其谅解。若施工单位已报警，应积极配合调查，如实陈述事实，争取从轻处理。
若款项为施工单位违法所得或用于违法活动：
- 法律后果：虽然你拿走的是违法所得或用于违法活动的款项，但你的行为本身仍然可能构成盗窃罪或侵占罪。此外，如果你明知款项来源或用途违法而仍参与其中，还可能涉及共犯或其他相关犯罪。
- 建议：同样应立即归还该款项，并向相关部门举报施工单位的违法行为。在举报时，应提供充分的证据和线索，以便相关部门进行调查处理。
二、行为情形分析
若你与施工单位存在劳动关系或合作关系：
- 法律后果：如果你利用职务之便或合作关系中的便利条件拿走款项，可能构成职务侵占罪或贪污罪（如果属于国家工作人员）。职务侵占罪是指公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的行为；贪污罪则是指国家工作人员利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取或者以其他手段非法占有公共财物的行为。
- 建议：除了立即归还款项外，还应主动向所在单位或相关部门说明情况，接受调查处理。如果构成犯罪，应积极配合司法机关的工作，争取从轻或减轻处罚。
若你与施工单位无直接关系：
- 法律后果：如前所述，可能构成盗窃罪或侵占罪。
- 建议：立即归还款项，并向施工单位道歉。如果施工单位已报警或准备采取法律行动，应积极配合调查，如实陈述事实，并考虑寻求法律帮助以维护自己的合法权益。
三、后续行动建议
- 归还款项：无论款项性质如何，你都应立即归还该款项，以减少损失和避免进一步的法律后果。
- 配合调查：如果施工单位或相关部门已介入调查，你应积极配合，如实陈述事实，提供相关证据和线索。
- 寻求法律帮助：如果你对法律后果不确定或担心自己的权益受到侵害，可以向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。
特别提醒：在任何情况下，都不应试图通过非法手段获取财物或逃避法律责任。诚实守信、遵纪守法是每个公民应尽的义务。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。