事业单位上班超过八小时是否合法，需分情况讨论：

1. 标准工时制下的合法性分析

根据《劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。若事业单位未与劳动者协商一致，也未依法申请综合计算工时或不定时工作制，单方面要求劳动者每日工作超过八小时，则属于违法行为。此时，劳动者有权要求单位支付加班费或拒绝超时工作。

1. 特殊工时制下的合法性分析

   • 综合计算工时制：若事业单位经劳动行政部门批准实行综合计算工时制，劳动者的工作时间可以在一定周期内综合计算。例如，以周、月、季、年为周期，只要平均日工作时间和平均周工作时间不超出法定标准，即使某日工作超过八小时，也不视为违法。但需注意，综合计算周期内的总实际工作时间不得超过总法定标准工作时间，超过部分应视为延长工作时间，并按规定支付加班费。

   • 不定时工作制：对于因生产特点、工作特殊需要或职责范围的关系，无法按标准工作时间衡量或需要机动作业的劳动者，事业单位可申请不定时工作制。在此制度下，劳动者的工作时间不受八小时限制，但单位应确保劳动者的休息权，并依法支付加班费（如法定节假日工作）。

2. 加班与加班费支付

   • 若事业单位因生产经营需要，经与工会和劳动者协商后，可以延长工作时间，但一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。
   • 延长工作时间应支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。

3. 劳动者权益保护

   • 劳动者有权拒绝单位违法要求的超时工作，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
   • 若单位因超时工作导致劳动者权益受损，如健康受损、未支付加班费等，劳动者可依法要求单位承担赔偿责任。

建议：

• 对于事业单位劳动者而言，若遇到超时工作情况，首先应与单位沟通，了解是否属于特殊工时制下的合法延长工作时间，并要求单位依法支付加班费。
• 若单位拒绝沟通或存在违法行为，劳动者可收集相关证据（如考勤记录、工作安排通知等），向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自身合法权益。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。