核心结论：若在小区里合法种树却被物业毁坏，您可以通过协商、投诉、诉讼等途径来维护自身权益，具体如下：
- 收集证据
- 种树合法性证据：首先要确认您种树的行为是合法的。比如，查看小区的物业管理规约、业主大会议事规则等相关文件，看是否有关于业主在小区内种树的规定。如果规约中没有禁止性规定，或者您种树的行为是经过业主大会或相关管理部门同意的，那么您种树就是合法的。收集相关的同意文件、会议记录等作为证据。
- 树木价值证据：对被毁坏的树木进行价值评估。可以请专业的林业评估机构或者有相关资质的人员对树木的品种、树龄、生长状况等进行评估，确定树木的价值。同时，拍摄树木被毁坏前后的照片、视频，记录毁坏的具体情况，如毁坏的方式、程度等。
- 物业毁坏证据：寻找能够证明是物业毁坏树木的证据，比如现场的监控录像、目击证人的证言等。如果有物业工作人员承认毁坏树木的录音、聊天记录等，也可以作为有力证据。
- 与物业协商
- 携带收集好的证据，与物业进行友好协商。向物业说明您种树的合法性以及树木的价值，要求物业对毁坏树木的行为进行道歉，并承担相应的赔偿责任。赔偿的范围可以包括树木的价值、因毁坏树木给您造成的其他损失，如重新种树的费用、因树木毁坏导致的环境改善损失等。
- 在协商过程中，要保持冷静和理性，避免情绪化的争吵。明确表达自己的诉求和期望的解决方案，争取通过协商达成一个双方都能接受的赔偿协议。
- 向相关部门投诉
- 向房地产行政主管部门投诉：如果与物业协商无果，您可以向当地的房地产行政主管部门（如房管局）投诉。房地产行政主管部门负责对物业公司的管理和监督，有权对物业公司的违法行为进行查处。
- 向城市管理部门投诉：如果物业毁坏树木的行为涉及到城市绿化管理方面的规定，您也可以向当地的城市管理部门（如城管局）投诉。城市管理部门有权对破坏城市绿化的行为进行处罚，并要求责任人恢复原状。
- 在投诉时，要提交详细的投诉材料，包括您收集的证据、事情的经过、您的诉求等。相关部门会在收到投诉后进行调查处理，并及时将处理结果反馈给您。
- 提起诉讼
- 如果通过协商和投诉都无法解决问题，您可以考虑向法院提起诉讼。以物业为被告，向法院提起民事诉讼，要求物业承担侵权责任，赔偿您的损失。
- 在起诉前，要准备好起诉状和相关证据材料。起诉状要明确写明原告和被告的基本信息、诉讼请求、事实和理由等内容。证据材料要能够充分证明物业的侵权行为以及您所遭受的损失。
- 法院会受理您的起诉，并进行审理。在审理过程中，您要积极配合法院的调查和审理工作，提供相关的证据和陈述。法院会根据事实和法律规定作出判决，如果判决物业承担赔偿责任，物业应当按照判决履行赔偿义务。