核心结论：业主可先与物业协商，若协商不成，根据不同情况可通过投诉、诉讼等途径解决，关键在于判断业主种树行为是否合法合规。以下是具体分析：

判断业主种树行为的合法性

1. 若业主种树行为合法
   • 依据：如果业主是在自己拥有合法使用权的土地范围内种树，比如自家专属的庭院等，且种树行为没有违反小区的规划、管理规约以及相关法律法规，那么业主对所种的树享有合法的财产权益。物业未经业主同意清理毁坏树木，属于侵犯业主财产权的行为。
   • 处理方式：
     • 协商：业主可以先与物业进行友好协商，要求物业对毁坏的树木进行赔偿，包括树木本身的价值以及因毁坏树木可能给业主带来的其他损失，如重新种植的费用、树木成长到原有状态的时间成本对应的价值等。
     • 投诉：如果协商不成，业主可以向小区的业主委员会投诉，由业主委员会出面协调解决。业主委员会作为业主自治组织，有责任维护业主的合法权益。
     • 诉讼：若通过上述方式仍无法解决问题，业主可以向法院提起民事诉讼，要求物业承担侵权责任，赔偿损失。在诉讼过程中，业主需要提供证据证明自己对树木拥有合法的财产权益以及物业的侵权行为和造成的损失，如种树的相关凭证、树木毁坏前后的照片、损失评估报告等。
2. 若业主种树行为不合法
   • 依据：如果业主是在小区的公共绿地、消防通道等禁止种植的区域种树，或者种树行为违反了小区的管理规约，那么业主的种树行为本身就不具有合法性。物业清理毁坏树木是为了维护小区的整体利益和公共秩序，在这种情况下，业主可能难以要求物业进行赔偿。
   • 处理方式：
     • 沟通：业主可以主动与物业沟通，了解物业清理树木的原因和依据，认识到自己行为的错误。如果业主认为物业的清理方式过于粗暴，给小区环境造成了不必要的破坏，也可以与物业协商要求其采取合理的补救措施，如对清理区域进行修复等。
     • 整改：业主应按照物业的要求或小区的管理规约，对违规种植的树木进行整改，如自行移除树木等，以避免进一步的纠纷和可能的处罚。