在政府采购中设置很高的企业资质是否合法，不能一概而论，需要结合具体情况和相关法律法规进行综合分析。以下从不同角度为你详细阐述：
合法情形
- 基于采购项目的特殊需求
- 如果政府采购的项目具有特殊性，例如涉及国家安全、国家秘密、抢险救灾等特殊项目，或者采购的货物、工程和服务具有高度的专业性、技术性要求，只有具备特定高资质的企业才能满足项目需求，那么设置较高的企业资质是合法的。
- 举例：政府采购一套高度复杂的军事通信设备，该设备需要企业具备先进的研发技术、严格的生产工艺和保密能力等，只有少数拥有高资质的企业能够提供符合要求的产品和服务。在这种情况下，设置较高的企业资质是为了确保采购项目的质量和安全，符合法律法规的规定。
- 法律依据：根据《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定，采购人可以根据采购项目的特殊要求，规定供应商的特定条件，但不得以不合理的条件对供应商实行差别待遇或者歧视待遇。这里的“特定条件”如果与采购项目的特殊需求相匹配，设置高资质就是合理的。
- 符合行业规范和标准
- 某些行业本身就有严格的资质要求，政府采购这些行业的产品或服务时，按照行业规范和标准设置企业资质是合法的。
- 举例：在建筑工程领域，对于一些大型的、技术复杂的工程项目，如超高层建筑、大型桥梁等，行业规定必须由具备相应高资质的建筑企业来承建。政府采购这类工程项目时，设置较高的企业资质要求，是遵循行业规范和标准的体现，符合法律规定。
不合法情形
- 以不合理条件限制或排斥潜在供应商
- 如果政府采购中设置的企业资质要求与采购项目的实际需求不相关，或者过高地提高了资质门槛，导致大多数潜在供应商无法参与竞争，从而限制或排斥了潜在供应商，这种设置就是不合法的。
- 举例：政府采购一批普通的办公用品，如纸张、笔等，这些产品的采购对企业的资质要求并不高，一般的企业都能够提供。但如果采购人设置要求供应商必须具备特定的、与办公用品采购无关的高资质，如建筑工程施工总承包特级资质，这就属于以不合理的条件限制或排斥潜在供应商，违反了《中华人民共和国政府采购法》的相关规定。
- 违反公平竞争原则
- 政府采购应当遵循公平竞争的原则，设置过高的企业资质可能会破坏公平竞争的市场环境，使一些有实力但资质稍低的企业无法参与竞争，从而损害了其他供应商的合法权益。
- 举例：在某政府采购项目中，采购人设置的企业资质要求只有少数几家企业能够满足，这些企业之间可能存在某种利益关联或者形成了垄断局面，导致其他企业无法公平参与竞争。这种设置高资质的行为就违反了公平竞争原则，是不合法的。
法律后果
如果政府采购中设置的企业资质不合法，可能会面临以下法律后果：
- 采购活动被责令改正：相关监管部门有权责令采购人改正不合理的资质设置行为，重新开展采购活动。
- 承担赔偿责任：如果因不合理的资质设置给供应商造成损失的，采购人可能需要承担相应的赔偿责任。
- 受到行政处罚：采购人及其相关责任人员可能会受到行政处罚，如警告、罚款等。
建议：政府采购人在设置企业资质时，应当严格按照法律法规的规定，结合采购项目的实际需求，合理确定资质要求，确保采购活动的合法性、公平性和公正性。如果你在政府采购中遇到企业资质设置相关的问题，或者有其他法律疑问，都可以直接向我咨询。