结论：单位将13薪当成年终奖发放是否违法，不能一概而论，需结合劳动合同、公司规章制度以及相关法律法规来综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、劳动合同与规章制度的角度
劳动合同有明确约定：
- 如果劳动合同中明确规定了13薪的发放时间、金额及性质（如固定工资的一部分），那么单位将其当成年终奖发放，可能构成违约。因为年终奖通常与公司的年度业绩、员工个人表现等因素挂钩，具有不确定性，而13薪若作为固定工资的一部分，则应按时足额发放。
公司规章制度有规定：
- 若公司规章制度中明确规定了13薪的发放方式和性质，且该规章制度经过民主程序制定并公示，对员工具有约束力。在此情况下，单位擅自改变发放方式，同样可能构成违约。
劳动合同与规章制度均无明确约定：
- 如果劳动合同和公司规章制度中均未对13薪的发放方式和性质作出明确规定，那么单位将其当成年终奖发放，可能不构成违法。因为在此情况下，单位对薪酬的发放方式享有一定的自主权。
二、法律法规的角度
《劳动法》与《劳动合同法》的相关规定：
- 根据《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。如果劳动合同或规章制度中明确规定了13薪的发放，单位未按时足额发放，则可能违反上述法律规定。
年终奖的法律规定：
- 目前，我国法律对年终奖的发放并无强制性规定，它属于用人单位的自主管理范畴。因此，单位有权根据自身情况决定是否发放年终奖以及发放的标准和方式。但是，如果单位在劳动合同或规章制度中明确规定了年终奖的发放，则应按照约定执行。
三、实际操作建议
查看劳动合同和规章制度：
- 员工应首先查看自己的劳动合同和公司规章制度，了解13薪的发放方式和性质是否已有明确规定。
与单位协商：
- 如果发现单位将13薪当成年终奖发放，且认为此做法违反了劳动合同或规章制度的规定，员工可以与单位进行协商，要求单位按照约定发放13薪。
寻求法律援助：
- 如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。在此过程中，建议员工保留好相关证据，如劳动合同、工资条、公司规章制度等。
总结：单位将13薪当成年终奖发放是否违法，需根据具体情况来判断。员工应首先查看劳动合同和公司规章制度，了解相关规定；如果认为单位做法违法，可以与单位协商或寻求法律援助。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。