在卖厂区时，若希望将厂区连同以前的纠纷一并转让，需在合同中明确约定纠纷的概括转移条款，并确保该条款符合法律规定且不损害第三方利益。 具体操作如下：

1. 明确纠纷概括转移条款
   在合同中应设置专门条款，明确约定“出让方将厂区所有权及与该厂区相关的所有历史纠纷（包括但不限于债权债务纠纷、行政处罚、诉讼仲裁等）一并转移至受让方，受让方同意承接并处理上述纠纷”。

   • 法律依据：根据《民法典》第五百五十五条，当事人一方经对方同意，可以将自己在合同中的权利和义务一并转让给第三人。纠纷的概括转移需以双方合意为基础，且不得违反法律强制性规定或损害第三方利益。
     
   • 操作要点：需列明纠纷类型（如未决诉讼、未清偿债务等），并约定纠纷处理的责任划分（如受让方承担全部责任，或双方按比例分担）。

2. 履行通知义务并取得第三方同意（如需）
   若纠纷涉及第三方（如债权人、诉讼相对方），需根据纠纷性质履行通知或同意程序：

   • 债权债务纠纷：若转让厂区涉及债务转移，需根据《民法典》第五百五十一条，取得债权人书面同意，否则债务转移对债权人不生效。
     
   • 未决诉讼/仲裁：需在合同中约定诉讼/仲裁结果的承担方，并建议受让方参与诉讼/仲裁程序，避免因程序瑕疵导致权益受损。
     
   • 行政处罚：若厂区存在未履行的行政处罚（如环保罚款），需在合同中明确处罚的承担方，并建议受让方在交易前通过行政机关查询处罚记录。

3. 设置违约责任与救济条款
   为保障合同履行，需约定：

   • 出让方义务：如实披露纠纷情况，若隐瞒或虚假陈述，需承担赔偿责任（如赔偿受让方因纠纷产生的损失）。
     
   • 受让方义务：按约定承接纠纷，若拒绝处理或拖延，需承担违约责任（如支付违约金）。
     
   • 争议解决：约定纠纷解决方式（如仲裁或诉讼），并明确管辖法院或仲裁机构。

4. 办理产权变更与纠纷承接手续

   • 产权变更：根据《民法典》第二百零九条，完成厂区所有权变更登记，确保受让方取得合法产权。
     
   • 纠纷承接证明：针对已披露的纠纷，可要求出让方出具书面承诺或与第三方签订协议，确认纠纷已转移至受让方。

风险提示：

• 若纠纷涉及刑事责任（如厂区存在非法排污等犯罪行为），刑事责任无法通过合同转移，需由原责任人承担。
  
• 若纠纷导致厂区被查封或拍卖，受让方可能面临产权风险，建议在交易前通过律师进行尽职调查。
  

建议：在签订合同前，委托律师对厂区进行全面尽职调查，梳理历史纠纷并评估风险，确保合同条款合法有效。若需进一步协助，可直接向我咨询。