针对您提出的“厂房出租合同中，假如甲方有经济纠纷该如何在合同中体现，作为乙方应如何撰写相关条款”的问题，以下是我的详细解答：
一、明确甲方经济纠纷的披露义务
条款设计：
- 在合同中应明确要求甲方披露其是否存在任何可能影响厂房出租或乙方使用的经济纠纷。这可以通过在合同中设置专门的“甲方声明与保证”条款来实现。
- 示例条款：“甲方声明并保证，其拥有厂房的合法出租权，且厂房不存在任何抵押、查封、扣押等可能影响乙方正常使用的经济纠纷或法律障碍。如因甲方未如实披露上述信息导致乙方遭受损失的，甲方应承担全部赔偿责任。”
法律后果：
- 若甲方未如实披露经济纠纷，导致乙方在使用厂房过程中受到干扰或损失，乙方有权依据合同条款要求甲方承担违约责任，包括但不限于赔偿损失、支付违约金等。
二、设置乙方权利保障条款
优先购买权或续租权（如适用）：
- 如果甲方因经济纠纷可能面临厂房被拍卖或转让的情况，乙方可以要求在合同中设置优先购买权或续租权条款，以保障其长期使用的稳定性。
- 示例条款：“如甲方因经济纠纷导致厂房被拍卖或转让的，乙方在同等条件下享有优先购买权。若乙方不行使优先购买权，则甲方应确保新业主继续履行本合同，或与乙方协商签订新的租赁合同，保障乙方的续租权。”
租金调整与减免：
- 在甲方经济纠纷可能影响厂房正常使用的情况下，乙方可以要求设置租金调整或减免条款，以减轻其经济负担。
- 示例条款：“如因甲方经济纠纷导致厂房无法正常使用超过一定期限（如30天）的，乙方有权要求甲方相应减免租金。如影响期限超过一定期限（如90天）且甲方未能解决的，乙方有权解除合同并要求甲方赔偿损失。”
三、明确违约责任与争议解决方式
违约责任：
- 在合同中应明确甲方未履行披露义务或违反其他合同条款时应承担的违约责任，包括赔偿损失、支付违约金等。
- 示例条款：“如甲方违反本合同任何条款，导致乙方遭受损失的，甲方应承担全部赔偿责任，并支付乙方相当于租金一定比例（如20%）的违约金。”
争议解决方式：
- 明确双方在合同履行过程中发生争议时的解决方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等。建议选择对乙方较为有利的争议解决方式，如选择乙方所在地法院管辖或约定仲裁机构等。
- 示例条款：“本合同在履行过程中发生的争议，双方应首先通过友好协商解决；协商不成的，任何一方均有权向乙方所在地人民法院提起诉讼。”
四、其他注意事项
合同审查与修改：
- 在签订合同前，乙方应仔细审查合同条款，确保所有条款均符合其利益需求。如有必要，可以聘请专业律师对合同进行审查或修改。
保留证据：
- 在合同履行过程中，乙方应妥善保管与合同相关的所有证据材料，如租金支付凭证、沟通记录等，以备不时之需。
及时沟通与协商：
- 如发现甲方存在经济纠纷或可能影响厂房正常使用的情况时，乙方应及时与甲方沟通并协商解决方案，以避免损失扩大。
总结：作为乙方，在厂房出租合同中明确甲方的经济纠纷披露义务、设置乙方权利保障条款、明确违约责任与争议解决方式等是保障自身权益的关键。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。