医疗事故协商后，若涉及刑事责任，当事人仍然有权向相关部门报案并启动刑事程序，但需注意刑事程序与民事协商的独立性及诉讼时效问题。以下是对此问题的详细分析：
一、刑事程序与民事协商的独立性
刑事责任与民事责任的区别：
- 刑事责任涉及对犯罪行为的法律制裁，由国家公诉机关（如检察院）提起公诉，旨在维护社会秩序和公共利益。
- 民事责任则关注于赔偿受害者因侵权行为所遭受的损失，由受害者或其家属提起民事诉讼，旨在恢复受害者的合法权益。
协商不影响刑事报案：
- 医疗事故协商主要解决的是民事赔偿问题，其结果并不影响当事人就同一事件向公安机关报案并启动刑事程序。
- 即使双方已经就民事赔偿达成协议，如果发现医疗机构或医务人员存在犯罪行为（如故意伤害、过失致人死亡等），当事人仍有权向公安机关报案。
二、刑事程序的启动条件
存在犯罪行为：
- 刑事程序的启动必须基于存在犯罪行为的事实。在医疗事故中，这可能包括医务人员的故意或过失行为导致患者死亡或严重伤害。
报案与立案：
- 当事人应向公安机关报案，并提供相关证据材料。公安机关在审查后，如果认为符合立案条件，将启动刑事侦查程序。
三、诉讼时效问题
刑事诉讼时效：
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，犯罪行为经过一定的期限后不再追诉。具体期限根据犯罪的性质和情节严重程度而定，如法定最高刑为不满五年有期徒刑的，经过五年不再追诉；法定最高刑为五年以上不满十年有期徒刑的，经过十年不再追诉等。
- 在医疗事故中，如果涉及刑事犯罪，且未超过诉讼时效期限，当事人仍有权报案并启动刑事程序。
民事诉讼时效：
- 民事诉讼时效通常为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。在医疗事故协商后，如果当事人发现新的损害事实或证据，且未超过民事诉讼时效期限，仍可以提起民事诉讼要求赔偿。
四、实际操作建议
及时报案：
- 如果当事人发现医疗机构或医务人员存在犯罪行为，应及时向公安机关报案，并提供相关证据材料。
保留证据：
- 在协商过程中，当事人应保留好所有与医疗事故相关的证据材料，如病历、诊断证明、医疗费用单据等。这些证据在后续的刑事或民事程序中可能起到关键作用。
咨询专业律师：
- 在处理医疗事故纠纷时，建议当事人咨询专业律师的意见。律师可以根据具体情况提供法律建议，帮助当事人制定合适的维权策略。
五、注意事项
- 刑事与民事程序的协调：虽然刑事程序与民事协商相互独立，但在实际操作中，当事人可能需要同时处理刑事和民事两个程序。这要求当事人具备较高的法律素养和应对能力，因此咨询专业律师尤为重要。
- 避免重复处理：在刑事程序启动后，如果民事赔偿问题已经通过协商解决，且赔偿金额合理，当事人可以在刑事程序中提出已赔偿的事实，以避免重复处理或过度赔偿。
总结来说，医疗事故协商后，若涉及刑事责任，当事人仍然有权向相关部门报案并启动刑事程序。在处理此类纠纷时，建议当事人及时报案、保留证据，并咨询专业律师的意见，以便更好地维护自己的合法权益。