结论：月薪资5000元，税前比税后一年多2万元的情况，在常规情况下是不合法的，但具体还需根据实际的工资构成、扣除项目以及税收政策等因素来判断。以下是对此问题的详细分析：
一、常规情况下的税收计算
应纳税所得额的计算：
- 根据个人所得税法，应纳税所得额是工资薪金所得减去各项扣除（如基本减除费用、专项扣除、专项附加扣除等）后的余额。
- 假设月工资5000元为应发工资，且没有其他扣除项目（如社保、公积金等），则应纳税所得额可能较低，甚至可能低于起征点（目前为5000元/月，但需注意，这里的5000元是应纳税所得额的起征点，与应发工资不同，实际计算中还需考虑各项扣除）。
个人所得税的计算：
- 根据应纳税所得额，按照个人所得税税率表计算应缴纳的个人所得税。
- 在应纳税所得额较低的情况下，个人所得税的税额也会相对较低。
税后工资的计算：
- 税后工资 = 应发工资 - 个人所得税 - 其他扣除（如社保、公积金等）。
- 在常规情况下，月工资5000元，税后工资与税前工资的差距不会达到一年2万元的程度。
二、可能存在的特殊情况
工资构成复杂：
- 如果工资构成中包含大量非税前工资部分（如奖金、津贴等），且这些部分在计算个人所得税时有不同的处理方式，可能导致税前与税后的差距较大。
- 但即便如此，一年差距2万元仍然较为异常，需要具体分析工资构成和税收政策。
税收优惠政策或特殊扣除：
- 某些地区或行业可能享有税收优惠政策，或者个人可能符合某些特殊扣除条件（如残疾、孤老、烈属等），这些因素可能影响个人所得税的计算。
- 但这些优惠政策或特殊扣除通常不会导致税前与税后的差距达到一年2万元。
错误计算或违规操作：
- 如果存在工资计算错误或违规操作（如少报、漏报个人所得税等），也可能导致税前与税后的差距异常。
- 这种情况下，需要纠正错误或接受税务部门的处罚。
三、法律建议
核实工资构成和扣除项目：
- 建议员工核实自己的工资构成和各项扣除项目，确保工资计算的准确性和合法性。
咨询税务部门或专业律师：
- 如果对工资计算或税收政策有疑问，可以咨询当地税务部门或专业律师（如我），以获取准确的法律意见和帮助。
维护自身权益：
- 如果发现工资计算存在错误或违规操作，应及时与雇主沟通并要求纠正。如果雇主拒绝纠正或存在其他违法行为，可以向劳动监察部门投诉或寻求法律救济。
四、数值计算（示例）
假设月工资5000元为应发工资，且没有其他扣除项目（仅为示例，实际情况可能更复杂）：
- 应纳税所得额：假设等于应发工资减去基本减除费用（5000元/月），则应纳税所得额为0元（实际中可能因其他扣除而有所不同）。
- 个人所得税：根据应纳税所得额，个人所得税为0元。
- 税后工资：5000元 - 0元 = 5000元。
- 一年税前与税后的差距：0元（因为每月税前与税后工资相同）。
显然，这个示例中的差距远小于一年2万元。因此，在常规情况下，月薪资5000元，税前比税后一年多2万元的情况是不合法的。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。