在我国刑事公诉案件中，被告人申请排除非法证据最晚应当在法庭辩论结束前提出。具体来说，可以从以下几个角度进一步阐述：

1. 法律依据
   根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十八条以及相关司法解释，被告人及其辩护人有权申请排除非法证据，且申请排除非法证据的，应当提供相关线索或者材料。虽然法律并未明确规定申请排除非法证据的最晚时间点，但结合《刑事诉讼法》第一百九十八条关于法庭调查和法庭辩论的程序规定，被告人最晚应在法庭辩论结束前提出申请。这是因为法庭辩论结束后，案件将进入评议和宣判阶段，此时再提出排除非法证据的申请，可能因程序问题难以得到法庭的及时审查和处理。

2. 实践操作
   在司法实践中，被告人及其辩护人通常会在以下时间节点提出排除非法证据的申请：

   • 庭前会议阶段：如果案件召开庭前会议，被告人可以在庭前会议中提出排除非法证据的申请，以便法庭提前审查并作出处理。
     
   • 法庭调查阶段：在法庭调查阶段，被告人可以在控方举证后，针对控方证据的合法性提出质疑，并申请排除非法证据。
     
   • 法庭辩论阶段：如果被告人认为有必要，也可以在法庭辩论阶段提出排除非法证据的申请，但此时应尽量提前，以确保法庭有足够的时间进行审查。

3. 注意事项

   • 及时性：被告人应尽早提出排除非法证据的申请，以便法庭能够及时审查并作出处理。如果申请过晚，可能会影响案件的审理进度和效率。
     
   • 证据支持：被告人在提出排除非法证据的申请时，应当提供相关线索或者材料，以支持其申请。这些线索或者材料可以包括证人证言、物证、书证等，能够证明证据收集过程中存在违法行为。
     
   • 程序合规：被告人在提出排除非法证据的申请时，应当遵守法庭程序，按照法庭的要求进行陈述和举证。如果违反法庭程序，可能会影响申请的审查和处理。

总结来说，虽然法律并未明确规定被告人申请排除非法证据的最晚时间点，但结合司法实践和程序要求，被告人最晚应在法庭辩论结束前提出申请。如果您或您身边的人遇到相关法律问题，欢迎直接向我咨询，我会结合具体情况为您提供更详细的解答。