发现财务科长挪用资金，应立即采取以下措施，并根据具体情况选择后续处理方式：

1. 立即固定证据并暂停其职务
   发现挪用行为后，第一时间收集关键证据（如银行流水、审批记录、资金流向凭证等），确保证据链完整。同时，根据公司章程或内部规定，立即暂停财务科长的职务，防止其继续操作资金或销毁证据。若涉及上市公司或国有企业，还需同步向董事会、监事会或上级主管部门报告。

2. 区分挪用性质，选择处理路径

   • 若挪用资金用于个人用途（如赌博、投资等）：
     这可能构成《刑法》中的挪用资金罪（非国家工作人员）或挪用公款罪（国家工作人员）。需立即向公安机关经侦部门报案，并提交证据材料。若挪用金额超过5万元（挪用资金罪）或3万元（挪用公款罪），且超过3个月未还，或用于营利/非法活动，公安机关将立案侦查。
     
   • 若挪用资金用于公司经营（如临时周转）：
     虽不构成刑事犯罪，但违反《公司法》中关于“高管忠实义务”的规定。公司可通过内部追责程序（如召开股东会/董事会），要求其返还资金并赔偿损失，同时可依据劳动合同或公司制度解除其职务。

3. 同步启动民事追偿程序
   无论是否构成刑事犯罪，公司均可通过民事诉讼要求财务科长返还挪用资金，并赔偿因挪用导致的利息损失、经营损失等。若挪用行为涉及与其他主体（如供应商、关联方）串通，还可将相关方列为共同被告，要求承担连带责任。

4. 完善内部风控，防范再次发生
   处理完当前事件后，需立即审查公司财务制度漏洞，例如：

   • 实行资金双签制（超过一定金额需两人审批）；
     
   • 定期轮岗审计，避免长期由同一人掌控财务；
     
   • 引入第三方财务软件，实现资金流向实时监控；
     
   • 对高管进行合规培训，明确挪用资金的法律后果。

特别提醒：若财务科长同时存在伪造账目、虚开发票等行为，可能涉及职务侵占罪或诈骗罪，需根据具体情节调整报案方向。处理过程中，建议由法务或律师全程参与，确保程序合法、证据有效。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。