结论：个人申请工伤但工伤不予受理的情况，公司是否会知道，这主要取决于申请工伤的具体流程以及相关信息的传递方式。在大多数情况下，如果工伤申请流程涉及到了公司的参与或者相关信息的公开，那么公司很可能会知道这一情况。

详细分析：

1. 工伤申请流程：

   • 通常情况下，工伤申请首先需要由受伤员工或者其近亲属向当地的社会保险行政部门提出。这个过程中，如果申请材料齐全且符合法定形式，社会保险行政部门会受理并展开调查。
   • 在调查过程中，社会保险行政部门可能会要求公司提供相关的证明材料，如劳动合同、工资单、考勤记录等，以核实工伤事实。这种情况下，公司自然会知道有员工申请了工伤。
   • 如果工伤申请被不予受理，社会保险行政部门通常会出具不予受理通知书，并说明理由。这个通知书可能会直接送达给申请人，但也有可能通过公司转交，尤其是当申请人是通过公司提交申请材料时。

2. 信息传递方式：

   • 如果工伤申请是通过公司内部流程（如人力资源部门）提交的，那么公司自然会在申请过程中得知相关信息。
   • 即使工伤申请是直接由员工或其近亲属提交给社会保险行政部门的，如果后续需要公司配合提供材料或进行其他操作，公司也会得知工伤申请的情况。
   • 另外，如果工伤申请被不予受理后，员工选择通过法律途径（如提起行政诉讼）来维护自己的权益，那么公司作为相关方，也很可能会被卷入其中，从而得知工伤申请及不予受理的情况。

3. 公司的知情权与义务：

   • 从法律角度来看，公司作为用人单位，有义务配合社会保险行政部门进行工伤调查，并提供必要的证明材料。因此，在工伤申请过程中，公司有权并应当知晓相关信息。
   • 同时，如果工伤申请被不予受理，且员工认为这一决定存在错误或不当，员工有权通过法律途径来维护自己的权益。在这个过程中，公司作为相关方，其知情权也是得到保障的。

建议：

• 如果你作为员工申请了工伤但被不予受理，且担心公司会因此对你产生不利影响，你可以先与公司进行沟通，解释情况并寻求公司的理解和支持。
• 如果公司对此事持消极态度或存在不当行为，你可以考虑向当地的社会保险行政部门或劳动监察部门投诉，以维护自己的合法权益。
• 在任何情况下，都建议你保留好相关的证据材料，如工伤申请材料、不予受理通知书等，以便在需要时提供证明。

后续行动：

• 如果你对工伤申请被不予受理的决定有异议，你可以在收到不予受理通知书后的一定期限内（具体期限根据当地法律法规而定）向社会保险行政部门提出复议申请或向人民法院提起行政诉讼。
• 在这个过程中，如果你需要法律帮助或咨询，可以随时向我提问，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。