结论：没有土地相关项目文件（如土地使用权证、建设用地规划许可证等）的情况下，原则上不应支付工程预付款，但需结合合同约定、项目性质及风险防控措施综合判断。 以下是具体分析：

1. 法律风险角度：预付款支付需以合法项目为前提

根据《民法典》第788条及《建筑法》相关规定，建设工程合同生效需满足两个核心条件：

• 项目合法性：建设单位需取得土地使用权证、建设工程规划许可证等法定文件，否则项目可能被认定为违法建筑，合同可能因违反法律强制性规定而无效；
  
• 资金用途合规性：预付款应用于项目前期准备（如材料采购、设备租赁等），若项目本身不合法，预付款可能被认定为“为非法活动提供资金”，存在被追缴或承担连带责任的风险。
  

例外情形：若项目已通过政府“容缺受理”程序（即部分文件暂缺但已获行政许可），且合同明确约定预付款支付条件（如以政府批文替代土地证），则可能具备合法性基础，但需严格审查批文效力及合同条款。

2. 合同约定角度：预付款支付条件由双方自主约定

若合同中未明确要求“以土地文件作为预付款支付条件”，则建设单位可能需按合同约定支付预付款。但需注意：

• 风险分配条款：若合同约定“预付款支付后因项目违法导致损失由承包方承担”，则建设单位可主张免责；
  
• 无效合同后果：若项目因无土地文件被认定无效，根据《民法典》第157条，预付款需返还，且双方可能需按过错比例分担损失（如建设单位未尽审查义务需承担部分责任）。

3. 实务操作建议：风险防控优先

即使合同未明确限制，从风险防控角度建议：

• 要求承包方提供担保：如银行保函、抵押等，确保预付款安全；
  
• 分阶段支付：将预付款拆分为“定金+进度款”，仅支付少量定金，剩余款项待土地文件补齐后支付；
  
• 书面确认风险：要求承包方签署《风险告知书》，明确其知晓项目文件缺失的法律后果。

总结：无土地项目文件时支付预付款存在重大法律风险，建议优先完善项目手续或通过合同条款、担保措施降低风险。若您需进一步分析具体合同条款或项目情况，可直接向我咨询。