结论：在公开招投标项目中，若合同未约定可以计算超程运输费用，结算时一般不可以直接计算该费用，但存在例外情况。以下从不同角度进行分析：
一、合同约定优先原则
在合同纠纷中，合同是双方当事人权利义务的直接依据。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，依法成立的合同，对当事人具有法律约束力。当事人应当按照约定履行自己的义务，不得擅自变更或者解除合同。因此，若合同中明确约定了超程运输费用的计算方式和标准，那么结算时应当按照合同约定进行计算。然而，在本案例中，合同并未约定可以计算超程运输费用，因此，从合同约定优先的原则出发，结算时一般不可以直接计算该费用。
二、例外情况分析
尽管合同未约定超程运输费用，但在某些特定情况下，结算时仍可能考虑该费用：
双方协商一致：如果双方当事人在合同履行过程中，就超程运输费用达成了新的协议或者补充协议，那么结算时应当按照新的协议或者补充协议进行计算。这体现了合同自由原则，即当事人有权在法律允许的范围内自由约定合同内容。
行业惯例或交易习惯：在某些特定行业或地区，可能存在关于超程运输费用的行业惯例或交易习惯。如果这些惯例或习惯被双方当事人所知晓并接受，且不违反法律、行政法规的强制性规定，那么结算时也可以考虑按照这些惯例或习惯进行计算。但需要注意的是，行业惯例或交易习惯的适用需要具备一定的条件，如双方当事人均知晓并接受、不违反法律强制性规定等。
公平原则和诚实信用原则：在合同履行过程中，如果因一方当事人的原因导致超程运输成为必要，且该超程运输费用未在合同中约定，那么根据公平原则和诚实信用原则，另一方当事人可能有权要求对方承担部分或全部超程运输费用。但这种情况需要具体分析，如超程运输的原因、双方当事人的过错程度、超程运输费用的合理性等。
三、法律建议
审查合同条款：首先，应当仔细审查合同条款，确认合同中是否确实未约定超程运输费用。如果合同中存在模糊或不明确的地方，应当及时与对方当事人进行沟通协商，以明确双方的权利义务。
收集证据材料：如果认为结算时应当考虑超程运输费用，那么应当收集相关证据材料，如超程运输的原因、距离、费用等，以证明自己的主张。
寻求法律途径解决：如果双方当事人无法就超程运输费用达成一致意见，那么可以通过法律途径解决纠纷。可以依法向人民法院提起诉讼或者申请仲裁机构进行仲裁。
在实际操作中，建议根据具体情况进行具体分析，并咨询专业律师以获取更准确的法律意见。如果你有任何法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的解答。