核心结论：两人签订合作办学协议后中途有人退出，具体处理方式需依据协议约定、退出原因及法律规定综合判断，常见处理方式包括按协议约定处理、协商解决、承担违约责任或依法清算等。以下是具体分析：

1. 优先查看合作办学协议中的退出条款
   若双方在协议中明确约定了退出机制（如退出条件、程序、责任承担等），则应优先按协议约定处理。例如：

   • 协议约定“一方退出需提前X个月书面通知，并支付违约金Y元”，则退出方需履行通知义务并支付违约金；
     
   • 协议约定“退出方需赔偿另一方因退出导致的直接损失”，则需根据实际损失（如招生费用、场地租赁损失等）进行赔偿。
     关键点：协议是双方意思自治的体现，只要不违反法律强制性规定，通常具有优先效力。

2. 协议无约定或约定不明时的处理方式
   若协议未约定退出机制或约定模糊，可按以下步骤处理：

   • 协商解决：双方可就退出时间、资产分割、债务承担等事项进行协商，并签订补充协议明确权利义务。
     
   • 依法清算：若合作办学已实际开展并产生资产（如设备、场地、学生学费等），需按《民法典》合伙合同相关规定进行清算：
     
     • 退伙人对退伙前合伙债务承担连带责任；
       
     • 剩余财产按出资比例或协议约定分配；
       
     • 若因一方退出导致合作无法继续，另一方可要求赔偿损失（如预期收益损失）。
       
   • 单方退出需承担违约责任：若退出方无正当理由单方退出，可能构成违约，需赔偿另一方因此遭受的损失（包括直接损失和可得利益损失）。

3. 特殊情形下的处理

   • 因不可抗力退出：若退出因自然灾害、政策调整等不可抗力导致，可部分或全部免除责任，但需及时通知对方并提供证明。
     
   • 对方严重违约：若因另一方根本违约（如挪用资金、未履行主要义务）导致退出，退出方可主张解除协议并要求赔偿，甚至无需承担违约责任。
     

建议：

1. 立即梳理合作办学协议、财务记录、沟通记录等证据材料；
   
2. 优先与对方协商，明确退出方案并签订书面协议；
   
3. 若协商不成，可委托律师介入，通过诉讼或仲裁解决争议。
   

如有进一步问题（如协议条款解读、损失计算等），可直接向我咨询。