边上班边仲裁并不算自动离职。劳动仲裁与劳动关系是否解除没有必然的因果联系，劳动关系的存续或解除需依据具体情况及法律规定来确定。以下从不同角度为你详细分析：
劳动关系存续的情况
如果劳动者在申请劳动仲裁时并未明确表示离职，且继续按照用人单位的要求正常出勤、提供劳动，同时用人单位也持续为劳动者发放工资、缴纳社保等，那么双方的劳动关系依然有效存续。例如，劳动者可能因用人单位拖欠加班工资而提起劳动仲裁，但在此期间仍然坚持到岗工作，这种情况下劳动关系并未解除。
劳动关系解除的情况
劳动者主动解除：
- 劳动者有权以书面等明确方式向用人单位提出离职，如提交辞职信。即便此时劳动仲裁正在进行中，从离职通知到达用人单位并符合相关法律规定的离职程序时起，劳动关系即告解除。
用人单位解除：
- 用人单位在劳动仲裁期间也可能因合理合法的理由（如劳动者严重违反规章制度）而解除与劳动者的劳动关系。但这种解除必须严格遵守法律规定的条件和程序，否则可能构成违法解除，劳动者有权在仲裁中主张相应权益。
仲裁裁决或法院判决解除：
- 在某些情况下，劳动仲裁裁决或法院判决可能会明确解除劳动关系。这通常发生在劳动争议涉及劳动合同无效、解除劳动合同等核心问题时。一旦裁决或判决生效，劳动关系即告解除。
法律建议
- 保留证据：在劳动仲裁期间，无论你是否继续上班，都应保留好与用人单位的沟通记录、工资条、考勤记录等证据，以备不时之需。
- 遵守规定：如果继续上班，应遵守用人单位的规章制度和劳动合同约定，正常出勤、提供劳动。
- 及时沟通：如果与用人单位就劳动关系解除等问题有协商或沟通，应及时记录并保留相关证据。
- 咨询专业：如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。
综上所述，边上班边仲裁并不构成自动离职，劳动关系的存续或解除需根据具体情况和法律规定来判断。希望以上分析能对你有所帮助。