可以以短信的方式告知对方分居，但需注意短信内容及后续证据保留的问题。以下从法律角度为你详细分析：

短信告知的法律效力

短信作为一种书面形式的沟通方式，在法律上具有一定的证明力。如果你通过短信明确告知对方你打算分居，并且短信内容清晰、明确，能够反映你的真实意愿，那么这条短信在法律上可以作为你分居意愿的证据之一。然而，短信的证明力相对较弱，因为它容易被篡改或伪造，且无法直接证明双方已经实际分居。

短信内容建议

为了确保短信的法律效力，建议你在短信中明确以下内容：

1. 分居的意愿：明确表达你打算与对方分居的意愿。
2. 分居的原因：简要说明分居的原因，如感情不和等。
3. 分居的时间：如果可能，可以提及分居的开始时间或预计持续时间。
4. 后续安排：如分居期间的居住安排、子女抚养等。

后续证据保留

除了短信外，为了更充分地证明双方已经实际分居，你还可以考虑保留以下证据：

1. 居住证明：如在外租房的租赁合同、水电费缴纳记录等，证明你已经在其他地方居住。
2. 通讯记录：除了短信外，还可以保留双方分居期间的通话记录、电子邮件、社交媒体聊天记录等，证明双方处于分居状态。
3. 亲友证言：如果有亲友知道并了解双方分居的情况，他们的证言也可以作为证据。
4. 分居协议：如果双方能够就分居达成一致意见，可以签订分居协议，明确双方的权利和义务。

注意事项

1. 短信的真实性：确保短信内容真实、未被篡改或伪造。
2. 证据的完整性：除了短信外，尽量收集其他相关证据，以形成完整的证据链。
3. 法律程序：如果双方最终决定离婚，分居事实只是法院判决离婚的一个考虑因素。你还需要通过法律程序（如协议离婚或诉讼离婚）来解除婚姻关系。

法律后果

如果双方因感情不和分居满两年，并且你能够提供充分的证据证明这一点，那么在诉讼离婚时，法院可能会将分居事实作为认定夫妻感情确已破裂的依据之一，从而判决准予离婚。然而，分居两年并不是自动离婚的条件，仍然需要通过法律程序来完成离婚过程。

总结来说，虽然可以以短信的方式告知对方分居，但为了确保短信的法律效力，建议你注意短信内容的明确性和真实性，并尽量收集其他相关证据来证明双方已经实际分居。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。