合伙开公司的合作协议不公证也是有效的。以下从多个角度为你详细分析：
一、合作协议生效的一般条件
根据《中华人民共和国民法典》第一百四十三条，一个民事法律行为（包括合作协议的签订）要具备法律效力，必须同时满足以下条件：
- 行为人具有相应的民事行为能力：这意味着所有参与签订合作协议的当事人都必须是具有完全民事行为能力的人，如年满18周岁且精神正常的自然人，或依法设立并具有相应民事权利能力和行为能力的法人、非法人组织。这一条件确保了合同各方能够独立实施民事法律行为，并清楚知晓自己行为的法律后果。
- 意思表示真实：合作协议的签订必须基于各方真实的意愿，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。合伙人应在充分了解协议条款和合伙事项的基础上，自愿作出签订协议的决定。这是保证协议内容反映各方真实意图的重要前提。
- 不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗：合作协议的内容必须符合法律法规的要求，不得违反法律法规的强制性规定，也不能违背社会公共秩序和善良风俗。否则，协议将因违法或违背公序良俗而无效。
二、公证在合作协议中的作用
公证是公证机构根据自然人、法人或其他组织的申请，依照法定程序对民事法律行为、有法律意义的事实和文书的真实性、合法性进行证明的活动。对于合作协议而言，公证并非其生效的必备要件。但经过公证的合作协议在发生纠纷时，其真实性和合法性往往更容易被法院等裁判机构认可，从而加强协议的证明效力。
三、特殊情况下的合作协议效力
如果合作协议中明确约定了“需经公证后才生效”的条款，那么在这种情况下，只有办理了公证手续，协议才具有法律效力。若未进行公证，则协议不生效。因此，在签订合作协议时，合伙人应仔细审查协议内容，明确是否包含此类特殊约定。
四、实际操作建议
- 确保协议内容合法合规：在签订合作协议前，合伙人应确保协议内容不违反法律法规的强制性规定，不违背公序良俗。这是协议具有法律效力的基础。
- 明确各方权利义务：合作协议应清晰载明合伙人的基本信息、合伙目的、出资方式、利润分配方式、亏损分担比例以及合伙事务的执行等关键事项。这有助于避免未来可能出现的纠纷。
- 考虑是否需要公证：虽然公证不是合作协议生效的必备条件，但考虑到公证可以增强协议的证明力与公信力，合伙人可以根据实际情况选择是否需要办理公证手续。
五、法律依据
- 《中华人民共和国民法典》第一百四十三条：具备下列条件的民事法律行为有效：（一）行为人具有相应的民事行为能力；（二）意思表示真实；（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
- 《中华人民共和国民法典》第四百六十五条：依法成立的合同，受法律保护。依法成立的合同，仅对当事人具有法律约束力，但是法律另有规定的除外。
综上所述，合伙开公司的合作协议不公证也是有效的，但应确保协议内容合法合规、明确各方权利义务，并根据实际情况考虑是否需要办理公证手续。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。