在刑事判决执行结束后，如果发现了新的证据，且这些证据有可能推翻原有的判决，这是一个涉及复杂法律程序的问题。以下是我为您详细梳理的处理策略：
一、评估新证据的性质与重要性
首先，您需要对新发现的证据进行仔细评估。这包括判断新证据是否具有实质性和关键性，即它是否能够直接证明原判决在事实认定或法律适用上存在错误。例如，新证据可能是一个新的目击者证言、一份新的物证，或者是一个能够证明被告人无罪或罪轻的科学鉴定报告。只有当新证据具有足够的证明力，才有可能影响原判决的效力。
二、申请再审的流程
确定申请主体与时间限制：
- 当事人（即被告人或被害人）及其法定代理人、近亲属有权向人民法院或人民检察院提出申诉，申请再审。
- 申诉通常应在判决、裁定发生法律效力后的两年内提出。但请注意，特定情形下，如可能宣告无罪或案件属于疑难、复杂、重大类别，可能不受此时间限制。
准备并提交材料：
- 在申诉时，您需要附上详细的再审申请书，说明申诉的理由和新证据的情况。
- 同时，您需要提交新证据的原件或复印件，以及任何能够证明新证据真实性和关联性的其他材料。
法院的审查与再审程序的启动：
- 法院将对您的申诉理由和新证据进行全面审查，评估其是否满足再审的法定条件。
- 如果法院认为申诉合理且新证据具有实质性影响，将决定启动再审程序。
再审的审理与裁决：
- 在再审过程中，法院将重新审理案件，对新证据进行深入调查、质证和认证。
- 法院将根据新证据和原有证据，重新评估案件的事实认定和法律适用，并作出相应的裁决。
三、人民检察院的抗诉权
- 如果人民检察院在发现新证据后认为原判决确有错误，它有权按照审判监督程序向人民法院提出抗诉。
- 抗诉程序涉及最高人民检察院对各级法院判决、裁定的监督，以及上级检察院对下级法院判决、裁定的监督。
- 接受抗诉的法院应组成合议庭重新审理案件，并根据新证据作出相应裁决。
四、公安机关的补充侦查与移送起诉（如适用）
- 如果新证据表明案件存在其他犯罪事实或遗漏犯罪嫌疑人，公安机关可进行补充侦查。
- 补充侦查完毕后，公安机关需将案件重新移送人民检察院审查起诉。
- 人民检察院将根据新证据情况，决定是否提起公诉或作出其他处理决定，如变更起诉罪名、增加指控犯罪事实等。
五、注意事项
- 在整个过程中，您应积极配合法院和检察机关的工作，提供必要的协助和信息。
- 申诉和抗诉均应遵循法定的时间和程序要求，以免错过维权机会。
- 新证据的发现和处理是刑事案件后续程序中的重要环节，直接关系到您的合法权益和司法公正的实现。
综上所述，刑事判决执行结束后发现新证据是一个涉及多方面法律程序和处理的复杂问题。您应充分了解相关法律规定，及时、正确地采取行动，以维护自身的合法权益。同时，司法机关也应依法、公正地处理此类案件，确保法律的正确实施和司法的公信力。