事业单位医疗系统禁止有吸毒前科人员报考，这一规定是否违反上位法，需分情况讨论：

1. 从法律法规的普遍原则来看：

   • 我国法律并未明确规定有吸毒前科的人员不得报考事业单位或医疗系统。事业单位的招聘条件通常由招聘单位根据岗位需求、行业特点以及相关法律法规自行设定，但这些条件不得违反国家法律法规的强制性规定，也不得侵犯公民的基本权利。
   • 如果事业单位医疗系统的招聘规定中明确禁止有吸毒前科人员报考，且这一规定没有明确的法律依据或上位法支持，那么该规定可能涉嫌违反平等就业的原则，即不得因个人过去的违法行为而歧视其就业机会，除非该违法行为与岗位需求直接相关且构成合理的招聘限制。

2. 从特殊岗位需求的角度来看：

   • 医疗系统作为关乎公众健康和安全的特殊行业，对从业人员的品德、行为以及健康状况有着较高的要求。如果招聘单位能够证明，有吸毒前科的人员在品德、行为或健康状况上可能存在不利于履行医疗职责的风险，且这种风险与岗位需求直接相关，那么招聘单位可能会基于这种合理的担忧设定相应的招聘限制。
   • 然而，即便如此，招聘单位也需要确保这种限制是必要且合理的，不能过度侵犯公民的就业权利。例如，招聘单位可以通过严格的背景调查、健康检查以及试用期考核等方式来评估应聘者的适合性，而不是简单地以有吸毒前科为由一概拒绝。

3. 从法律实践的角度来看：

   • 在实际法律实践中，对于事业单位招聘条件的合法性审查，通常会考虑招聘条件是否与岗位需求直接相关、是否必要且合理、是否侵犯了公民的基本权利等因素。如果招聘条件被认为违反了上述原则，那么该条件可能会被认定为无效。
   • 因此，如果事业单位医疗系统的招聘规定中禁止有吸毒前科人员报考，且这一规定被认为违反了平等就业的原则或侵犯了公民的基本权利，那么该规定可能会面临法律挑战。

建议：

• 对于事业单位医疗系统而言，在设定招聘条件时，应充分考虑岗位需求、行业特点以及相关法律法规的规定，确保招聘条件的合法性和合理性。
• 对于有吸毒前科但希望报考事业单位医疗系统的人员而言，如果认为招聘条件侵犯了其合法权益，可以通过法律途径进行维权，如向相关部门投诉、申请行政复议或提起行政诉讼等。

总结来说，事业单位医疗系统禁止有吸毒前科人员报考是否违反上位法，取决于该规定是否与岗位需求直接相关、是否必要且合理、是否侵犯了公民的基本权利等因素。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。