三人共同共有房产变更为按份共有，需要缴纳一定的费用，主要包括税费和登记费。具体分析如下：
税费方面：
- 契税：根据相关规定，共有不动产的份额发生变化，一般视为房屋权属发生转移，需要缴纳契税。契税的计税依据为房屋权属转移合同确定的成交价格，包括货币、实物和其他经济利益对应的价款。税率根据当地的具体规定执行，通常在1%~3%之间。不过，如果三人之间是直系亲属关系，且符合当地规定的免税条件，可能可以免征契税。
- 个人所得税：如果共有房产在变更份额过程中产生了收益（如房屋增值部分），且不符合免税条件，那么可能需要缴纳个人所得税。但通常情况下，三人之间按约定份额共有房产，并未产生实际的收益分配，因此可能不需要缴纳个人所得税。不过，具体还需根据当地税务部门的规定和实际情况来判断。
- 印花税：根据印花税的相关规定，产权转移书据需要缴纳印花税。因此，在三人共同共有房产变更为按份共有的过程中，需要签订产权转移书据，并缴纳相应的印花税。印花税的税率较低，通常为合同金额的万分之五。
登记费方面：
- 在变更房产共有份额的过程中，还需要向房地产登记机构申请变更登记，并缴纳相应的登记费。登记费的具体金额根据当地的规定执行，通常不会太高。
行动建议：
- 在进行房产份额变更前，建议先咨询当地的税务部门和房地产登记机构，了解具体的税费政策和登记流程。
- 根据当地的规定和实际情况，准备好相关的税费和登记费用。
- 在签订产权转移书据时，务必明确各方的权利和义务，以及份额的具体比例，以避免后续产生纠纷。