在机动车与非机动车发生交通事故且被认定为主次责任时，保险公司的理赔流程是一个涉及多个环节、需要细致处理的过程。以下是一个清晰、详细且深入的解答：

一、责任划分与保险类型

1. 责任划分：

   • 根据交警部门出具的事故认定书，明确机动车和非机动车各自的责任比例。主次责任通常按7:3或8:2的比例分担损失，但具体比例需以事故认定书为准。

2. 保险类型：

   • 交强险：机动车必须投保的强制保险，用于赔偿第三方（包括非机动车）的人身伤亡和财产损失。其赔偿限额包括死亡伤残赔偿限额18万元、医疗费用赔偿限额1.8万元、财产损失赔偿限额0.2万元。
   • 商业险：如第三者责任险等，是机动车可自愿投保的险种，用于补充交强险赔偿不足的部分。

二、理赔流程

1. 报案：

   • 事故发生后，立即向保险公司报案，提供事故时间、地点、经过等基本信息。
   • 保留现场照片、视频等证据，以便后续理赔时使用。

2. 定损与核赔：

   • 保险公司派员到现场查勘，评估损失情况，包括人身伤害和财产损失。
   • 根据事故认定书和责任比例，确定赔偿金额。

3. 提交材料：

   • 向保险公司提交事故认定书、医疗证明、维修发票、收入证明等相关材料。
   • 确保材料真实、完整，以免影响理赔进度。

4. 审核与支付：

   • 保险公司审核材料后，按照约定支付赔偿金额。
   • 赔偿金额可能包括医疗费、误工费、护理费、残疾赔偿金（如构成伤残）、财产损失等。

三、理赔原则与注意事项

1. 交强险优先赔付：

   • 无论机动车是否有责任，交强险都应在限额内先行赔付非机动车的损失。
   • 交强险赔偿不足的部分，由商业险或机动车方自行承担。

2. 责任比例分摊：

   • 根据事故认定书确定的责任比例，计算机动车和非机动车各自应承担的赔偿金额。
   • 例如，若机动车承担70%的责任，则非机动车的损失中，70%由机动车方（通过保险）承担，30%由非机动车方自行承担。

3. 赔偿项目与标准：

   • 人身损害赔偿包括医疗费、误工费、护理费、残疾赔偿金、死亡赔偿金等，具体标准根据受害人的实际情况和法律规定确定。
   • 财产损失赔偿包括直接财产损失（如非机动车维修费用）和间接财产损失（如替代性交通工具费用）。

4. 争议处理：

   • 若对理赔结果有异议，可向保险公司提出申诉或向监管部门投诉。
   • 必要时，可通过法律途径解决争议，如申请仲裁或提起诉讼。

四、案例说明

假设一起交通事故中，机动车与非机动车相撞，交警认定机动车承担70%的责任，非机动车承担30%的责任。非机动车方受伤住院，产生医疗费5万元，误工费1万元，财产损失2000元。机动车方投保了交强险和第三者责任险（保额100万元）。

• 交强险赔付：非机动车方的医疗费和财产损失在交强险限额内先行赔付，假设医疗费赔付1万元，财产损失赔付2000元。
• 商业险赔付：剩余医疗费4万元和误工费1万元，共计5万元，由机动车方承担70%，即3.5万元。这部分费用由商业险在保额范围内赔付。
• 非机动车方自负：非机动车方需自行承担剩余30%的费用，即1.5万元。

在处理机动车与非机动车交通事故主次责任的理赔时，请务必遵循法律法规和保险合同约定，保留好相关证据和单据，并在必要时咨询专业律师或向相关部门申请复核，以确保双方权益得到妥善保护。