针对您提出的“女员工怀孕居家办公怎么发工资”的问题，这是一个涉及劳动法权益保障的重要议题。以下是我为您详细梳理的解答：
一、基本原则
劳动报酬权：
- 无论女员工是在公司上班还是居家办公，只要她按照用人单位的要求提供了正常劳动，就应当获得相应的劳动报酬。这是《劳动法》所明确保障的基本权益。
同工同酬原则：
- 居家办公期间，如果女员工能够完成其本职工作，且工作质量与在公司工作时相当，那么她的工资应与公司工作时保持一致，即按照原有的工资标准进行计算和发放。
二、具体工资计算方式
劳动合同或规章制度有明确约定：
- 如果用人单位与女员工在劳动合同中明确约定了居家办公期间的工资计算方式，或者用人单位的规章制度中有相关规定，并且这些约定或规定不违反法律法规的强制性规定，那么应当按照这些约定或规定来计算工资。
- 示例：若公司规章制度规定居家办公期间工资按正常出勤工资的90%发放，女员工月工资标准为5000元，则居家办公期间每月工资为4500元。
女员工正常提供劳动：
- 如果女员工居家办公期间能够正常提供劳动，完成工作任务，那么她的工资待遇应与正常出勤相同，包括基本工资、奖金、津贴等。
- 示例：女员工与公司签订的劳动合同约定月工资为6000元（基本工资4000元+绩效奖金2000元），居家办公期间绩效达标，则公司应按月支付6000元工资。
女员工未正常提供劳动：
- 双方协商：如果女员工因身体原因等未能正常提供劳动，用人单位可以与她协商工资待遇。但需要注意的是，支付的工资不得低于当地最低工资标准。
- 无协商安排：如果用人单位没有安排女员工工作，那么应按不低于当地最低工资标准的一定比例支付生活费。具体比例由各省、自治区、直辖市规定。
- 示例：某地最低工资标准为2000元，规定未安排工作按70%支付生活费。女员工因身体不适无法正常工作，公司也未安排任务，则公司每月应支付1400元生活费。
三、争议解决途径
- 如果用人单位没有相关的规章制度或劳动合同中没有明确的约定，而双方又无法达成一致意见，那么可以通过协商、调解或劳动争议仲裁等方式来解决争议。
- 在此过程中，女员工可以寻求专业律师的帮助来维护自己的合法权益。
四、特别提醒
- 女员工在怀孕期间享有特殊的劳动保护权益，用人单位应当予以充分尊重和保障。
- 如果女员工在居家办公期间遇到工资发放问题或其他劳动权益受损情况，应及时与用人单位沟通协商，并保留好相关证据以便维权。
综上所述，女员工怀孕居家办公的工资计算方式需严格遵循法律法规和劳动合同约定，确保女员工在提供正常劳动的情况下获得应有的劳动报酬。同时，双方应通过协商和沟通来确定公平合理的工资标准，以维护女员工的合法权益。