针对您提出的“运输合同没有约定付运费期限，如何计算诉讼时效”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

一、一般诉讼时效规定

根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这一规定同样适用于运输合同中关于运费的债权。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。但需注意，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院将不予保护，除非有特殊情况并经法院决定延长。

二、没有约定付款期限时的诉讼时效起算点

在运输合同没有约定付运费期限的情况下，诉讼时效的起算点是一个关键问题。根据相关法律规定及实践，我们可以分以下几种情况来讨论：

1. 双方事后未达成补充协议且无法确定履行期限：

   • 根据《民法典》第五百一十一条，债务人可以随时履行，债权人也可以随时请求履行，但应当给对方必要的准备时间。
   • 在运输合同中，这意味着承运人可以随时向托运人主张运费，而诉讼时效则从承运人向托运人主张权利且托运人明确表示拒绝支付运费之日起开始计算。

2. 承运人持续提供运输服务且双方未进行阶段性结算：

   • 在这种情况下，诉讼时效不宜起算，因为运输服务尚未结束，且双方未就运费进行阶段性结算。
   • 直至运输服务结束且承运人向托运人主张结算运费，而托运人拒绝或未在合理期限内答复时，诉讼时效才开始起算。

三、诉讼时效的中断与中止

在诉讼时效期间内，还可能发生诉讼时效中断或中止的情况，这会影响诉讼时效的计算：

1. 诉讼时效中断：

   • 根据《民法典》第一百九十五条，权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务、权利人提起诉讼或申请仲裁等情形都会导致诉讼时效中断。
   • 中断后，诉讼时效期间重新计算。例如，如果承运人在诉讼时效期间内向托运人提出了支付运费的请求，那么诉讼时效将从该请求提出之日起重新计算三年。

2. 诉讼时效中止：

   • 根据《民法典》第一百九十四条，在诉讼时效期间的最后六个月内，因不可抗力、无民事行为能力人或限制民事行为能力人没有法定代理人等法定事由导致不能行使请求权的，诉讼时效中止。
   • 待中止事由消除后，继续计算剩余的诉讼时效期间。自中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。

四、特殊运输方式的诉讼时效规定

对于特定类型的运输合同，法律有特殊的诉讼时效规定：

1. 内河货物运输或国际海上货物运输：诉讼时效期为一年，自承运人交付或者应当交付货物之日起计算。
2. 铁路货物运输：诉讼时效期为180日，同样自承运人交付或者应当交付货物之日起计算。
3. 航空货物运输：诉讼时效期为二年，自民用航空器到达目的地点、应当到达目的地点或者运输终止之日起计算。

五、结论与建议

综上所述，运输合同没有约定付运费期限时，诉讼时效的计算需综合考虑合同类型、法律规定及案件具体情况。在发现权利受到损害后，承运人应及时采取措施保护自己的权益，并在适用的诉讼时效期间内提起诉讼或主张权利。同时，注意保留相关证据，如运输合同、货物交接单、运费主张记录等，以便在必要时证明自己的权利。

对于复杂或不确定的情况，我建议您咨询专业律师以获取更准确的法律意见。律师可以根据您的具体情况，结合相关法律法规和司法实践，为您提供更具针对性的建议和指导。